Milieu de culture: Une Revue
  1. Meenakshi Arora Ph. D.
    arormx at UPMC dot EDU
Traducteur
  1. Galet Colette Ph. D.
    cogalet at gmail dot com
    Université de Californie à Los Angeles, États-Unis
DOI
http://dx.doi.org/10.13070/mm.fr.3.175
Date
dernière modification : 2013-10-21; version originale : 2013-01-01
Cite as
MATER METHODS fr 2013;3:175
Introduction

La culture cellulaire est devenue une des techniques les plus utilisées en Sciences de la vie et représente le terme général utilisé lorsque des cellules, tissus, organes d’un animal ou d’une plante sont retirés et placés dans un environnement artificiel propice à la croissance. Les conditions principales pour permettre aux cellules de se diviser de manière optimale incluent: une température contrôlée, un substrat adapté pour l’adhésion des cellules, un milieu de culture approprié et un incubateur permettant le maintien d’un pH et de l’osmolarité corrects. L’étape la plus importante en culture cellulaire animale est la sélection d’un milieu de culture approprié pour la culture in vitro. Un milieu de culture est un liquide ou un gel conçu pour permettre la croissance de microorganismes, de cellules ou de petites plantes. Le milieu de culture est le facteur le plus complexe et le plus important pour le contrôle de la croissance cellulaire optimale. Le milieu de culture contient généralement la source d’énergie appropriée aux cellules et des composés qui régulent le cycle cellulaire. Un milieu de culture typique est composé d’un complément d’acides aminés, vitamines, sels minéraux, glucose et de sérum comme source de facteurs de croissance, hormones, et facteurs d’adhésion. En plus de l’apport de nutrients, le milieu de culture permet aussi le maintien du pH et de l’osmolarité du système de culture.

Types de milieux de culture

Les cellules animales peuvent être cultivées en utilisant soit un milieu complètement naturel ou un milieu synthétique complété par des produits naturels.

Milieux naturels

Un milieu naturel est constitué uniquement de fluides biologiques d’origine naturelle. Le milieu naturel est très utile et convient à une large gamme de culture de cellules animales. Mais le désavantage majeur de l’utilisation de milieux naturels est le manque de reproductibilité car la composition exacte de ces milieux naturels n’est généralement pas connue.

Milieux artificiels

Les milieux artificiels ou synthétiques sont préparés artificiellement par addition de plusieurs nutrients (organiques et inorganiques), de vitamines, de sels, d’O2 et de CO2, de protéines sériques, de carbohydrates et de cofacteurs [1]. Différents milieux artificiels ont été développés pour les raisons suivantes:

  • Survie immédiate (solution saline équilibrée avec un pH et une osmolarité spécifique)
  • Survie prolongée (solution saline équilibrée supplémentée avec des formulations variées de composés organiques et//ou de sérum)
  • Croissance indéfinie
  • Fonctions spécialisées.
Catégories de milieux.

Les différents milieux artificiels développés pour la culture cellulaire peuvent être groupés dans les quatre catégories suivantes:

Milieux contenant du sérum: Le Sérum Fœtal Bovin (FBS) est le supplément le plus commun pour les milieux de culture animale. Il est utilisé comme supplément de coût relativement faible pour obtenir un milieu de culture optimal. Ces suppléments apportent des transporteurs ou des chélateurs pour les nutrients labiles ou insolubles dans l’eau, des hormones et facteurs de croissance, des inhibiteurs de protéases et, ils lient et neutralisent les composés toxiques.
Milieux sans sérum: La présence de sérum dans le milieu a plusieurs désavantages et peut être la source de mauvaises interprétations dans les études immunologiques [2] [3]. Pour éliminer ce problème, un nombre de milieux sans sérum ont été développés [4] [5]. Ces milieux sont généralement formulés spécifiquement pour supporter la culture d’un seul type cellulaire et incorporent des quantités définies de facteurs de croissance purifiés, lipoprotéines et autres protéines normalement fournies par le sérum [6]. Ces milieux sont aussi appelés “milieux de culture définis” car les composés de ces milieux sont connus de manière précise. [Waymouth C. Preparation and use of serum-free culture media. Dans: Barnes DW, Sirbasku DA, Sato GH, editors. Methods for preparation of media, supplements and substrata for serum-free animal cell culture. New York: Liss; 1984] [Mendelson J, Caviles A Jr, Castagnola J. Culture of Humain lymphocytes in serum-free medium. Dans: Barnes DW, Sirbasku DA, Sato GH, editors. Methods for serum-free culture of neuronal and lymphoid cells. New York: Liss; 1984].

Milieux définis chimiquement: Ces milieux contiennent des composés inorganiques ultra purs sans contamination et des ingrédients organiques. Ils peuvent aussi contenir des additifs protéiques purs tels que des facteurs de croissance [7]. Ces constituants sont produits en bactéries ou en levures par génie génétique avec addition de vitamines, cholestérol, acides aminés spécifiques et acides gras [8].

Milieux sans protéines: Les milieux sans protéines ne contiennent aucune protéine et ne contiennent que les constituants non protéiques nécessaires à la culture cellulaire. Par rapport aux milieux supplémentés avec du sérum, l’utilisation de milieux sans protéine permet une croissance cellulaire et une expression de protéines supérieures et facilite la purification du produit exprimé [9] [10] [11]. Les milieux MEM, RPMI-1640 etc. sont sans protéine et la supplémentation en protéines est fournie si nécessaire.

Plusieurs types de milieux naturels et artificiels sont décrits dans la table I.

Type de milieuExemplesUsages
Milieux naturels Fluides biologiques plasma, sérum, lymphe, sérum de de corde ombilicale humaine, fluide amniotique
extraits de tissusExtrait de foie, spleen, tumeurs, leucocytes et moelle osseuse, extrait d’embryons bovin et/ou de poulet
caillotscoagulants ou caillots plasmatiques
Milieux artificielssolutions salines équilibréesPBS, DPBS, HBSS, EBSS Forment la base de milieux plus complexes
Milieux de baseMEM DMEM culture primaire et diploïde
Milieux complexesRPMI-1640, IMDM Supportent la culture d’une grande variété de cellules mammaliennes
Table 1. Types de milieux naturels et artificiels.
Composants de base des milieux

Les milieux de culture contiennent un mélange d’acides aminés, glucose, sels, vitamines et autres nutrients et sont disponibles chez de nombreux fournisseurs soit sous forme de poudre soit sous forme liquide [Freshney RI. Culture of animal cells: A manual of basic technique. 5th ed. New York: Wiley; 2005] [Freshney RI. Basic principles of cell culture. Hoboken: John Wiley and Sons; 2006] [Ham RG, MeKeehan WL. Nutrional requirements for clonal growth of nontransformed cells. Dans: Katsuta H, editor. Nutrional requirements of cultured cells. Baltimore: University Park Press; 1978] [12] [13]. Les besoins pour ces composés varient en fonction des lignées cellulaires, de ce fait, il existe un grand nombre de formulations [14]. Chaque composant a une fonction spécifique comme décrit ci-dessous:

Systèmes tampon

La régulation du pH est cruciale pour obtenir les conditions optimales de croissance et est généralement obtenue grâce à l’un de ces deux systèmes tampon :

Système tampon naturel

Système où le gaz CO2 équilibre le contenu en CO3/HCO3 du milieu de culture. Les cultures utilisant un système tampon naturel doivent être maintenues à une atmosphère contenant 5-10% CO2 dans l’air, généralement obtenu grâce à l’utilisation d’un incubateur à CO2. Le système tampon naturel est généralement peu coûteux et non toxique [15] [Rothblat GH, Cristofalo VJ. Growth, Nutrition and Metabolism of cells in culture. New York: Academic Press; 1972].

HEPES

Système tampon chimique utilisant un zwitterion. HEPES possède une capacité tampon supérieure dans la zone de pH 7.2-7.4 et ne nécessite pas une atmosphère gazeuse contrôlée [16]. HEPES est relativement cher et toxique à des concentrations élevées pour certains types cellulaires. HEPES augmente également la sensibilité du milieu aux effets phototoxiques induit par l’exposition aux lumières fluorescentes [17].

Rouge de Phénol

La plupart des milieux de culture disponibles commercialement contiennent du rouge de Phénol comme indicateur de pH ce qui permet de contrôler constamment le pH [18]. Pendant la croissance cellulaire, le milieu change de couleur lorsque le pH change du fait de la libération de métabolites par les cellules. A pH faible, le rouge de phénol rend le milieu jaune alors qu’à des pH élevés le milieu tourne au violet. Le milieu devrait être rouge vif pour un pH de 7.4 qui est optimum pour la culture cellulaire. Cependant, il y a certains désavantages à l’utilisation du rouge de phénol:

  • Le rouge de phénol peut imiter l’action de certaines hormones stéroïdes, en particulier, l’estrogène. Il est donc préférable d’utiliser un milieu sans rouge de phénol pour les études sur cellules sensibles aux estrogènes tel que le tissu mammaire.
  • La présence de rouge de phénol dans certaines formulations sans sérum interfère avec l’homéostasie sodium-potassium. Cet effet peut être neutralisé par l’introduction de sérum ou d’hormones hypophysaires bovines dans le milieu [Karmiol S. Development of serum free media. Dans: Master JRW, editor. Animal Cell culture, 3rd ed. Oxford:Oxford University Press; 2000]
  • Le rouge de phénol interfère avec la détection dans les études en cytométrie de flux.
Sels minéraux

Les sels minéraux dans les milieux aident à maintenir l’équilibre osmotique des cellules et aident à réguler le potentiel membranaire en apportant des ions sodium, potassium et calcium [19].

Acides Aminés

Comme les acides aminés sont les composants des protéines, leur présence dans les milieux de culture est donc indispensable. Les acides aminés essentiels doivent etre inclus dans le milieu de culture car les cellules ne peuvent pas les synthétiser elles-mêmes. Ces acides aminés sont requis pour la prolifération cellulaire et leur concentration détermine la densité cellulaire. La L-glutamine, un acide aminé essentiel, est particulièrement importante en culture cellulaire [20]. La L-glutamine apporte de l’azote à NAD, NADPH et aux nucléotides et sert de source secondaire d’énergie pour le métabolisme. La L-glutamine est un acide aminé instable qui, avec le temps, est converti en une forme non utilisable par les cellules. Elle doit donc être ajoutée au milieu juste avant l’utilisation [21]. Des précautions doivent être prises quand la L-glutamine est ajoutée en quantité plus importante que ce qui est nécessaire car sa dégradation induit une accumulation d’ammoniac, et l’ammoniac a des effets délétères sur certaines lignées cellulaires. Les concentrations de L-glutamine pour les milieux de culture de cellules mammaliennes varient de 0.68 mM dans Medium 199 à 4mM dans le Dulbecco’s Modified Eagles’s Medium. Les milieux de culture d’Invertébrés peuvent contenir jusqu’à 12.3 mM de L-glutamine. Les suppléments tel que glutamax sont plus stables and peuvent remplacer la glutamine pour les cultures à long terme de cellules à croissance lente.

Les acides aminés non-essentiels peuvent également être ajoutés au milieu de culture pour remplacer ceux qui ont été épuisés pendant la croissance. La supplémentation du milieu avec des acides aminés non-essentiels stimule la croissance et prolonge la viabilité des cellules.

Carbohydrates

Les carbohydrates sous la forme de sucres sont la source d’énergie majeure. La plupart des milieux contiennent du glucose et du galactose, cependant, certains contiennent du maltose et du fructose.

Protéines et peptides

Les protéines et peptiques les plus couramment utilisés sont l’albumine, la transferrine, et la fibronectine. Elles sont particulièrement importantes dans les milieux sans sérum. Le sérum est une source riche en protéines dont l’albumine, la transferrine, l’aprotinine, la fétuine, et la fibronectine. L’albumine est la protéine majeure du sang à lier l’eau, les sels, les acides gras libres, les hormones et les vitamines. Elle les transporte entre les tissues et les cellules. La capacité de liaison de l’albumine en permet l’élimination convenable des substances toxiques du milieu de culture.L’aprotinine est un agent protecteur dans les systèmes de culture de cellules, stable à pH acide ou neutre.Elle est résistante aux températures élevées et à la dégradation par les enzymes protéolytiques. L’aprotinine inhibe plusieurs sérine protéases telle que la trypsine.

La fétuine est une glycoprotéine présente en grande quantité dans le sérum fœtal ou de nouveaux nés par rapport au sérum d’adulte. C’est aussi un inhibiteur de sérine protéases.

La fibronectine est essentielle à l’adhésion cellulaire.

La transferrine est une protéine de transport du fer qui permet l’apport de fer à la membrane cellulaire.

Acides gras et Lipides

Ils sont particulièrement importants dans les milieux sans sérum car généralement fournis par l’ajout de sérum.

Vitamines

Beaucoup de vitamines sont essentielles à la croissance et prolifération cellulaire. Les vitamines ne peuvent pas être synthétisées en quantité suffisante par les cellules et sont donc des suppléments importants requis en culture cellulaire. Une fois de plus, le sérum est la source majeure de vitamines en culture cellulaire, cependant, les milieux sont aussi enrichis avec différentes vitamines afin d’être adaptés à une lignée cellulaire particulière. Les vitamines du groupe B sont le plus souvent ajoutées pour stimuler la croissance.

Oligo-éléments

Les oligo-éléments sont souvent ajoutés aux milieux sans sérum pour remplacer ceux généralement trouvés dans le sérum. Les oligo-éléments tels que le cuivre, le zinc, le sélénium et les intermédiaires de l’acide tricarboxylique sont des éléments chimiques qui sont nécessaires en très faibles quantités pour une croissance cellulaire correcte [22]. Ces micro-nutrients sont essentiels pour de nombreux processus biologiques tels que le maintien de la fonctionnalité des enzymes.

Suppléments

Les milieux de croissance recommandés pour certaines lignées cellulaires nécessitent des composants additionnels qui ne sont pas présents dans le milieu et dans le sérum. Ces composants, suppléments, aident au maintien de la prolifération et du métabolisme cellulaire normal [23] [24]. Bien que les suppléments tels que les hormones, les facteurs de croissance et les substances de signalisation soient nécessaires à la croissance normale de certaines lignées cellulaires, il est toujours bon de prendre les précautions suivantes: l’addition de suppléments peut changer l’osmolarité du milieu de croissance complet ce qui peut affecter négativement la croissance cellulaire. Il est donc toujours important de revérifier l’osmolarité après l’addition de suppléments. Pour la plupart des lignées cellulaires l’osmolarité doit être entre 260 mOSM/kg et 320 mOSM/kg.

La durée de vie du milieu de culture change après l’addition de suppléments. Les milieux complets contenant des suppléments protéiques ont tendance à se dégrader plus rapidement que les milieux de base.

Antibiotiques

Bien que pas nécessaire à la croissance cellulaire, les antibiotiques sont souvent utilisés pour contrôler la croissance des contaminants bactériens et fongiques [25]. L’utilisation routinière d’antibiotiques en culture cellulaire n’est pas recommandée car les antibiotiques peuvent masquer les contaminations par les mycoplasmes et les bactéries résistantes [26] [27]. De plus, les antibiotiques peuvent aussi interférer avec le métabolisme de cellules sensibles.

Le sérum dans les milieux

Le sérum est un mélange complexe d’albumines, de facteurs de croissance et d’inhibiteurs de croissance [28]. Le sérum est un des composants les plus importants des milieux de culture et sert de source d’acides aminés, de protéines, de vitamines (en particulier, les vitamines liposolubles telles que les vitamines A, D, E, et K), de carbohydrates, de lipides, d’hormones, de facteurs de croissance, de minéraux, et d’oligo-éléments. Le sérum provenant de fœtus ou de nouveaux nés bovins est couramment utilisé pour soutenir la croissance des cellules en culture [29]. Le sérum fœtal est une source riche en facteurs de croissance et est approprié pour le clonage de cellules et la croissance de cellules difficiles [30]. Le sérum de nouveaux nés(FCS) est utilisé dans les études d’inhibition du contact car il n’induit pas une croissance cellulaire aussi rapide que le FBS. Les milieux de croissance normaux contiennent généralement 2 à 10% de sérum. La supplémentation des milieux avec du sérum a pour fonction [31] :

  • L’apport de nutrients de base (en solution et liés aux protéines).
  • L’apport de facteurs de croissance et hormones impliqués dans la promotion de la croissance et des fonctions spécifiques des cellules.
  • L’apport de plusieurs protéines de liaison comme l’albumine, la transferrine, qui peuvent transporter d’autres molécules dans les cellules. Par exemple, l’albumine transporte les lipides, les vitamines, les hormones, etc. dans les cellules.
  • L’apport de protéines, comme la fibronectine, qui soutient l’adhésion cellulaire au substrat.
  • L’apport de facteurs de dissémination qui aident les cellules à se répandre uniformément dans le flacon de culture avant de commencer à se diviser.
  • L’apport d’inhibiteurs de protéases qui protègent les cellules de la protéolyse.
  • L’apport de minéraux, comme Na+, K+, Zn2+, Fe2+, etc.
  • L’augmentation de la viscosité du milieu qui protège les cellules de dommages mécaniques pendant l’agitation des cultures en suspension.
  • L’effet tampon.

Du fait de la présence simultanée de facteurs et d’inhibiteurs de croissance, le rôle du sérum est très complexe. Malheureusement, en plus de servir différentes fonctions, l’utilisation de sérum en culture cellulaire présente plusieurs désavantages [32] [33] [10]. (Table 2)

AvantagesDésavantages
Présence de facteurs de croissance et hormones qui stimulent la croissance et les fonctions cellulairesManque d’uniformité dans la composition des différents sérums
Aide à l’adhésion cellulaireTests doivent être faits pour assurer le maintien de la qualité de chaque lot
Agit comme facteur d’expansion Peut contenir des inhibiteurs de croissance
Agit comme agent tampon permettant le maintien du pH du milieu de culture. Augmente le risque de contamination
Fonctionne comme protéine de liaisonLa présence de sérum dans le milieu peut interférer avec la purification et l’isolation de produits issus de la culture cellulaire
Minimise les dommages mécaniques causés par l’agitation des cultures cellulaires en suspension
Table 2. Avantages et désavantages de l’utilisation de sérum dans les milieux de culture.
Préparation des milieux

Le milieu de culture est disponible sous trois formes chez les fournisseurs :

  1. En poudre: il doit donc être préparé et stérilisé par le chercheur.
  2. Sous forme concentrée: Il doit être dilué par le chercheur.
  3. Prêt à l’emploi: il peut être utilisé directement sans manipulation supplémentaire.

Le milieu en poudre est le moins cher mais doit être stérilisé [34]. Il est mieux de stériliser le milieu par filtration avant addition du sérum car la formation de mousse liée à la présence du sérum peut entrainer la dénaturation des protéines. Le sérum fœtal bovin ou équin peut être ajouté après la filtration. Le milieu devrait toujours être testé pour sa stérilité en le plaçant dans un incubateur à CO2 à 37oC pour 72 heures avant l’utilisation pour s’assurer que le lot n’était pas contaminé. Le milieu doit être conservé à 4oC. Comme plusieurs composants sont sensibles à la lumière, le milieu doit être conservé dans le noir.

Critères de sélection des milieux
Les lignées cellulaires

Le choix du milieu de culture est extrêmement important et affecte grandement le succès des expériences de culture de cellules [35]. La sélection du milieu dépend du type de cellules cultivées, du but de l’expérience et des ressources disponibles dans le laboratoire [36] [37]. Différent types cellulaires ont des besoins très spécifiques pour la croissance, donc les spécifications du milieu doivent être déterminées expérimentalement pour chaque type cellulaire [Sato JD, Hayashi I, Hayashi J, Hoshi H, Kawamoto T, McKeehan WL et al. Specific cell types and their requirements. Dans:Davis JM, editor. Basic Cell Culture: A Practical Approach. Oxford: Oxford University Press; 1994] [38] [39]. En général, Il est toujours bon de commencer avec le milieu MEM pour les cellules adhérentes et RPMI-1640 pour les cellules en suspension. La table# 3 décrit les lignées cellulaires communément utilisées et les milieux de culture recommandés.

Lignée cellulaireMorphologieEspèceMilieuApplications
HeLa BEpithélialeHumainMEM+ 2mM Glutamine+ 10% FBS + 1% Acides aminés Non Essentiels (NEAA) Etude de l’oncogenèse et des virus
HL60 LymphoblasteHumainRPMI 1640 + 2mM Glutamine + 10-20% FBSEtude de différenciation
3T3 clone A31FibroblasteSourisDMEM + 2mM Glutamine +5% New Born Calf Sérum (NBCS) + 5% FBSEtude de l’oncogenèse et des virus
COS-7 FibroblasteSingeDMEM+ 2mM Glutamine + 10% FBSEtude de l’expression de gènes et de la réplication de virus
CHO Epithéliale HamsterHam′s F12 + 2mM Glutamine + 10% FBS Etudes nutritionnelles et de l’expression de gènes
HEK 293 Epithéliale Humain EMEM (EBSS) + 2mM Glutamine + 1% NEAA + 10% FBSEtude de transformation
HUVEC EndothélialeHumain F-12 K + 10% FBS + 100 µg/ml HéparineEtude de l’angiogenèse
Jurkat LymphoblasteHumain RPMI-1640 + 10% FBS Etude de la signalisation cellulaire
Table 3. Lignées cellulaires communes et milieux de culture recommandés
Culture de cellules primaires

Les cultures de cellules primaires apportent des données uniques et précieuses en recherche, mais souvent le nombre de cellules est une limite. Pour de tels échantillons, surtout provenant de biopsies de tissus humains, un milieu de qualité est requis. La plupart des compagnies scientifiques distribuent des milieux complets, supplémentés et prêts à l’emploi. Ceci réduit le risque de contamination, le coût, l’effort fourni et gagne du temps éliminant les étapes de préparation et de supplémentation nécessaires. De plus, tous ces milieux sont sujets à des tests de contrôle de qualité extensifs et chaque lot est testé régulièrement pour la promotion de la croissance, l’absence de cytotoxicité, et les paramètres physiques tels que l’osmolarité et le pH. La table# 4 décrit les milieux recommandés pour les cultures de cellules primaires, disponibles commercialement.

CellulesMilieux
Cellules endothélialesEndoGRO-LS Complete Media Kit (EMD Millipore), HUVEC Basal Medium CB HUVEC (AllCells), Human Endothelial-SFM (Life Technologies), Endothelial Cell Medium (ScienCell Research Laboratories)
Cellules de moelle osseuseMarrowMAX Bone Marrow Medium (Life Technologies), Bone Marrow Medium Plus (Sigma)
Cellules glialesGIBCO® Astrocyte Medium
Cellules épithélialesEpithéliale cell medium (ScienCell Research Laboratory), EpiGRO primary Epithéliale cells (EMD Millipore)
Lymphocytes THumain StemXVivo Serum-Free T cell Base Media (R&D systems), Stemline T cell Expansion Medium (Sigma Aldrich)
Cellules souches hématopoïétiquesStemPro-34 SFM (Life Technologies), MethoCult (STEMCELL Technologies, Inc)
Table 4. Milieux recommandés pour les cellules primaires couramment utilisées
Milieux de culture communs

Les milieux de culture les plus communément utilisés incluent les milieux suivants et sont présentés en détails par Sigma, ATCC, et Life Technologies.

Eagle’s Minimum Essential Medium (EMEM)

EMEM a été parmi les premiers à être utilisé et a été formulé par Harry Eagle à partir d’un milieu de base plus simple (BME). EMEM contient une solution saline équilibrée, des acides aminés non essentiels et du pyruvate de sodium. Il est formulé avec une concentration réduite en bicarbonate de sodium (1500 ml/l) pour l’utilisation avec 5% CO2. Comme EMEM est un milieu simple, il est généralement complété avec des suppléments ou des concentrations de sérum plus élevées le rendant adéquat pour une large gamme de cellules mammaliennes.

Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium (DMEM)

DMEM contient presque deux fois la concentration d’acides aminés et quatre fois plus de vitamines qu’EMEM, de même que du nitrate ferrique, du pyruvate de sodium, et des acides aminés supplémentaires. La formulation originale contenait 1,000 mg/L de glucose et était la première utilisée pour la culture de cellules embryonnaires de souris. Une formulation avec 4500 mg/L de glucose a été démontrée optimale pour la culture de divers types cellulaires. DMEM est un milieu de base qui ne contient ni protéines ni d’agents supportant la croissance cellulaire. Il est donc nécessaire de supplémenter le DMEM pour que le milieu soit complet. DMEM est généralement supplémenté avec 5-10% de FBS. DMEM utilise un système tampon de bicarbonate de sodium (3.7 g/L) et, donc, requiert des niveaux artificiels de CO2 pour maintenir le pH. Le milieu en poudre est formulé sans bicarbonate, il requiert donc l’addition de 3.7 g/L de bicarbonate de sodium après dissolution dans l’eau. DMEM était initialement utilisé pour la culture de cellules souches embryonnaires de souris. Il est maintenant largement utilisé pour la culture de cellules primaires de souris, cellules de poulet, la formation de plaques virales et les études d’inhibition de contact.

RPMI-1640

RPMI-1640 est un milieu à usage général avec une large gamme d’applications pour les cellules mammaires, particulièrement les cellules hématopoïétiques. RPMI-1640 a été développé à Roswell Park Mémorial Institute (RPMI), Buffalo, New York. RPMI-1640 est une modification du milieu McCoy’s 5A et a été développé pour la culture à long terme des lymphocytes provenant du sang périphérique. RPMI-1640 utilise un système tampon au bicarbonate et diffère des autres milieux de cultures de cellules mammaliennes car sa formulation typique présente un pH de 8. RPMI-1640 supporte la croissance d’une large variété de cellules en suspension et adhérentes. Si il est supplémenté correctement avec du sérum ou les produits de remplacement adéquats, RPMI-1640 a une large gamme d’applications pour les cultures de cellules mammaliennes, dont la culture de lymphocytes humains fraichement isolés, les protocoles de fusion et la croissance de cellules hybrides.

Mélanges de nutrients Ham’s

A l’origine, ils ont été développés pour supporter la surcroissance clonale des cellules ovariennes de Hamster chinois (CHO). Il y a eu de nombreuses modifications à la formulation originale dont le milieu Ham’s F-12, un milieu plus complexe que l’original F-10 adapté à la propagation cellulaire sans sérum. Les mélanges ont été formulés pour l’utilisation avec ou sans apport de sérum en fonction du type de cellules cultivées.

Ham’s F-10: supporte la croissance de cellules diploïdes humaines et de globules blancs pour l’analyse de chromosome.

Ham’s F-12:supporte la croissance d’hépatocytes primaires de rat et des cellules épithéliales de prostate de rat. Ham’s F-12:supplémenté avec 25 mM HEPES permet un meilleur effet tampon.

Les modifications de Coon du milieu Ham’s F-12: ces modifications consistent à presque deux fois plus d’acides aminés et de pyruvate que dans le F-12 plus de l’acide ascorbique. Il a été développé pour la culture de cellules hybrides produites par fusion virale.

DMEM/F12: C’est un mélange de DMEM et de Ham’s F-12 qui est extrêmement riche et complexe. Il supporte la croissance d’une grande variété de types cellulaires avec ou sans sérum. Le tampon HEPES est inclus dans la formulation à une concentration finale de 15 mM pour compenser la perte d’effet tampon due à l’élimination du sérum.

Iscove’s Modified Dulbecco’s Medium (IMDM)

IMDM est un milieu synthétique hautement enrichi, adapté aux cultures de cellules à prolifération rapide et de haute densité. IMDM est une modification du DMEM contenant du sélénium, des acides aminés, vitamines et sels minéraux additionnels. Il contient du nitrate de potassium nitrate au lieu de nitrate ferrique et contient aussi de l’HEPES et du pyruvate de sodium. Il a été formulé pour la croissance des lymphocytes et des hybridomes. Des études ont montrées qu’IMDM peut supporter la croissance de lymphocytes B murin, de tissus hématopoïétiques provenant de la moelle osseuse, de cellules B stimulées avec des lipopolysaccharides, les lymphocytes T, et une variété de cellules hybrides.

MilieuTissu ou lignée cellulaire
MEM embryofibroblaste de poussin, cellules CHO, cellules de nerf embryonnaire, cellules de type alvéolaire, endothélium, épiderme, fibroblaste, glie, gliome, tumeurs humaines, mélanome
DMEM Endothélium, cellules épithéliales fœtale alvéolaires de type II , épithélium du cervix, cellules gastro-intestinales, neuroblastome de souris, cellules de la glande thyroïde porcine, lignées cellulaires de carcinome ovarien, cellules de muscles squelettiques, cellules de Sertoli, fibroblastes de hamster Syrien
RPMI-1640 cellules T et thymocytes, cellules souches hématopoïétiques, tumeurs humaines, lignées cellulaires de leucémie myéloïde humaine, lignées cellulaires de leucémie lymphoblastoide humaine, myélome de souris, leucémie de souris, erythroleucémie de souris, hybridome de souris, cellules hépatiques de rat
Nutrient mixture F-10 and F-12 Rétine pigmentée d’embryon de poulet, os, cartilage, tissus adipeux, cellules embryonnaires de poumon, cellules de muscles squelettiques
IMDM moelle osseuse, progéniteurs hématopoïétiques , lignées cellulaires de leucémie lymphoblastoide humaine
Table 5. Milieux communs et leurs applications
Optimisation des milieux de culture

La complexité de la composition des milieux de culture apporte de nombreux challenges à l’optimisation de composants individuels des milieux. Les milieux de cultures les plus classiques ont été conçus pour des cultures à petite échelle et de faible densité et requièrent souvent du sérum comme nutrient clé. Cependant en industrie biotechnologique ou il est nécessaire de maintenir des cultures à haute densité et d’augmenter la productivité cellulaire, le développement et l’optimisation du milieu de culture est très important [40]. Généralement, les milieux pour l’industrie biotechnologique sont sans sérum et ont des concentrations largement supérieures en nutrients que les milieux classiques [41] [42]. L’optimisation des milieux nécessitent de considérer les paramètres suivants:

Produit devant être synthétisé

Le type de produit exigé va déterminer la stratégie d’optimisation du milieu.

Pour la génération rapide des produits, le nombre de cellules, le taux de croissance cellulaire et la viabilité sont essentiels. Le milieu de culture doit donc supporter une croissance cellulaire maximale et maintenir la viabilité cellulaire à des densités cellulaires élevées.

Pour la production de virus, de hautes densités cellulaires sont requises mais il faut également que les nutrients soit abondant dans le milieu pour soutenir la réplication virale après infection.

Pour la production de protéines recombinantes, Une densité de cellules élevée est nécessaire. Cependant, les nutrients nécessaires pour la croissance cellulaire peuvent entrer en compétition avec ceux requis pour la production de protéines. Il est donc essentiel de déterminer précisément la densité de cellules maximale pouvant être supportée par un milieu donné pour atteindre le niveau de productivité requis. De plus, il est très important de considérer que les changements apportés au milieu pendant l’optimisation n’affectent pas la qualité du produit final.

Lignées cellulaires utilisées

Différentes lignées cellulaires ont des besoins en nutrients différents du fait de leur métabolisme qui conditionne les méthodes d’optimisation du milieu. Les lignées cellulaires les plus communément utilisées en industrie biotechnologique sont; les cellules CHO, BHK-21, cellules d’hybridomes, cellules de myélomes, et des fibroblastes diploïdes normaux. Certaines lignées cellulaires ont des besoins nutritionnels spécifiques, tels que du cholestérol pour les cellules de myélome NSO. Les fibroblastes diploïdes normaux requièrent des facteurs d’adhésion. Ils se développent à de faibles densités et, donc, ne nécessitent pas de grandes quantités de nutrients. Les lignées cellulaires d’hybridomes généralement dépendent fortement de la présence de glutamine Typiquement, elles atteignent une phase stationnaire après avoir atteint un pic de densité cellulaire puis leur viabilité décline rapidement. L’optimisation du milieu doit donc réduire le déclin de viabilité et améliorer la production d’anticorps monoclonal.

Procédé de fabrication impliqué

Le procédé de fabrication affecte non seulement le choix du milieu de culture mais également les méthodes d’optimisation. Les différents procédés de fabrication sont:

Traitement par lot: Un seul milieu est utilisé pour soutenir la croissance cellulaire et la productivité. Le milieu doit donc être riche en nutrients tout en restant dans les limites acceptables pour les cellules.

Procédé en « Fed-batch »: Plusieurs types de milieux sont utilisés durant la culture cellulaire en fonction du stade du processus. Un milieu de croissance est conçu de sorte qu’il soit pauvre en nutrients quand la densité cellulaire est faible pendant l’inoculation mais permet le maintien des taux de croissance cellulaire élevés pendant la phase d’augmentation de la culture et les débuts de la production. Un milieu de production présentant des concentrations élevées de nutrients par rapport au milieu de croissance peut aussi être utilisé lorsque la culture atteint le stade de la production.

Challenges dans le développement de milieux

La technologie de développement de milieu de culture cellulaire a énormément progressée durant les dernières décennies. Trouver un milieu de culture adéquat est important pour la performance de la culture cellulaire. De nos jours, le challenge est de développer un milieu sophistiqué qui peut être optimisé individuellement pour une variété de lignées cellulaires. La diversité des lignées cellulaires et l’implication d’un large nombre de composants dans le milieu rend ceci difficile. Le fait que beaucoup de ces composants soient interdépendants à cause de la complexité du métabolisme cellulaire s’ajoute à la complexité du développement du milieu.

Références
  1. Morgan J, Morton H, Parker R. Nutrition of animal cells in tissue culture; initial studies on a synthetic medium. Proc Soc Exp Biol Med. 1950;73:1-8 PMID 15402504
  2. Kerbel R, Blakeslee D. Rapid adsorption of a foetal calf serum component by mammalian cells in culture. A potential source of artifacts in studies of antisera to cell-specific antigens. Immunology. 1976;31:881-91 PMID 1086828
  3. Sula K, Draber P, Nouza K. Addition of serum to the medium used for preparation of cell suspensions as a possible source of artifacts in cell-mediated reactions studied by means of the popliteal lymph node test. J Immunogenet. 1980;7:483-9 PMID 7240766
  4. Mariani E, Mariani A, Monaco M, Lalli E, Vitale M, Facchini A. Commercial serum-free media: hybridoma growth and monoclonal antibody production. J Immunol Methods. 1991;145:175-83 PMID 1765649
  5. Barnes D, Sato G. Methods for growth of cultured cells in serum-free medium. Anal Biochem. 1980;102:255-70 PMID 6999941
  6. Iscove N, Melchers F. Complete replacement of serum by albumin, transferrin, and soybean lipid in cultures of lipopolysaccharide-reactive B lymphocytes. J Exp Med. 1978;147:923-33 PMID 305462
  7. Nagle S. Heat-stable chemically defined medium for growth of animal cells in suspension. Appl Microbiol. 1968;16:53-5 PMID 5636473
  8. Stoll T, Muhlethaler K, von Stockar U, Marison I. Systematic improvement of a chemically-defined protein-free medium for hybridoma growth and monoclonal antibody production. J Biotechnol. 1996;45:111-23 PMID 9147446
  9. Darfler F. A protein-free medium for the growth of hybridomas and other cells of the immune system. In Vitro Cell Dev Biol. 1990;26:769-78 PMID 2118498
  10. Barnes D, Sato G. Serum-free cell culture: a unifying approach. Cell. 1980;22:649-55 PMID 7460009
  11. Hamilton W, Ham R. Clonal growth of chinese hamster cell lines in protein-free media. In Vitro. 1977;13:537-47 PMID 562838
  12. Ham R, McKeehan W. Media and growth requirements. Methods Enzymol. 1979;58:44-93 PMID 423781
  13. Heby O, Emanuelsson H. Role of the polyamines in germ cell differentiation and in early embryonic development. Med Biol. 1981;59:417-22 PMID 6803080
  14. Eagle H. Nutrition needs of mammalian cells in tissue culture. Science. 1955;122:501-14 PMID 13255879
  15. Howorth P. The physiological assessment of acid-base balance. Br J Dis Chest. 1975;69:75-102 PMID 237527
  16. Shipman C. Evaluation of 4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineëthanesulfonic acid (HEPES) as a tissue culture buffer. Proc Soc Exp Biol Med. 1969;130:305-10 PMID 5762514
  17. Zigler J, Lepe-Zuniga J, Vistica B, Gery I. Analysis of the cytotoxic effects of light-exposed HEPES-containing culture medium. In Vitro Cell Dev Biol. 1985;21:282-7 PMID 4019356
  18. Reznikov B. [Incubation of Brucella on solid nutrient media with a phenol red indicator]. Veterinariia. 1972;7:109-10 PMID 4579994
  19. Cinatl J. Inorganic-organic multimolecular complexes of salt solutions, culture media and biological fluids and their possible significance for the origin of life. J Theor Biol. 1969;23:1-10 PMID 5798215
  20. Lane C, Pax R, Bennett J. L-glutamine: an amino acid required for maintenance of the tegumental membrane potential of Schistosoma mansoni. Parasitology. 1987;94:233-42 PMID 3588012
  21. Pasieka A, Morgan J. Glutamine metabolism of normal and malignant cells cultivated in synthetic media. Nature. 1959;183:1201-2 PMID 13657053
  22. Sternberg J, Benoit J, Mercier A, PAQUETTE J. ROLE OF SOME TRACE ELEMENTS (ZINC AND COBALT) IN THE GROWTH OF B.C.G. Rev Can Biol. 1964;23:353-65 PMID 14237169
  23. Bettger W, Boyce S, Walthall B, Ham R. Rapid clonal growth and serial passage of human diploid fibroblasts in a lipid-enriched synthetic medium supplemented with epidermal growth factor, insulin, and dexamethasone. Proc Natl Acad Sci U S A. 1981;78:5588-92 PMID 7029539
  24. Bottenstein J, Hayashi I, Hutchings S, Masui H, Mather J, McClure D, et al. The growth of cells in serum-free hormone-supplemented media. Methods Enzymol. 1979;58:94-109 PMID 423795
  25. Perlman D. Use of antibiotics in cell culture media. Methods Enzymol. 1979;58:110-6 PMID 423753
  26. McGarrity G. Spread and control of mycoplasmal infection of cell cultures. In Vitro. 1976;12:643-8 PMID 1034618
  27. Masters J, Stacey G. Changing medium and passaging cell lines. Nat Protoc. 2007;2:2276-84 PMID 17853884
  28. Lane B, Miller S. Preparation of large numbers of uniform tracheal organ cultures for long term studies. I. Effects of serum on establishment in culture. In Vitro. 1976;12:147-54 PMID 942941
  29. von Seefried A, Macmorine H. The use of foetal, calf and adult bovine sera for the growth of serially subcultivated diploid cells. Dev Biol Stand. 1976;37:83-9 PMID 1036405
  30. Hornsby P, Sturek M, Harris S, Simonian M. Serum and growth factor requirements for proliferation of human adrenocortical cells in culture: comparison with bovine adrenocortical cells. In Vitro. 1983;19:863-9 PMID 6654379
  31. Kragh-Hansen U. Molecular aspects of ligand binding to serum albumin. Pharmacol Rev. 1981;33:17-53 PMID 7027277
  32. Ulreich J, Chvapil M. Altered activity in cultured cells caused by contaminants in tubes widely used for blood collection and serum preparation. In Vitro. 1982;18:117-21 PMID 7084972
  33. Sandstrom C, Miller W, Papoutsakis E. Serum-free media for cultures of primitive and mature hematopoietic cells. Biotechnol Bioeng. 1994;43:706-33 PMID 18615795
  34. Kenny C, Diena B, Greenberg L. Autoclaving: a modification in the preparation of tissue culture medium 199. Can J Microbiol. 1972;18:272-3 PMID 4622989
  35. Weller T, Wheeldon S. The cultivation in vitro of cells derived from adult Schistosoma mansoni. I. Methodology; criteria for evaluation of cultures; and development of media. Am J Trop Med Hyg. 1982;31:335-48 PMID 7072898
  36. Yang H. [Selection of culture media for human and rabbit corneal epithelia]. Zhonghua Yan Ke Za Zhi. 1991;27:351-3 PMID 1818825
  37. Clifford W, Anellis A, Ross E. Evaluation of media, time and temperature of incubation, and method of enumeration of several strains fo Clostridium perfringens spores. Appl Microbiol. 1974;27:784-92 PMID 4363558
  38. Schumpp B, Schlaeger E. Optimization of culture conditions for high cell density proliferation of HL-60 human promyelocytic leukemia cells. J Cell Sci. 1990;97:639-47 PMID 1963891
  39. McKeehan W, Barnes D, Reid L, Stanbridge E, Murakami H, Sato G. Frontiers in mammalian cell culture. In Vitro Cell Dev Biol. 1990;26:9-23 PMID 2407711
  40. Chambers S, Swalley S. Designing experiments for high-throughput protein expression. Methods Mol Biol. 2009;498:19-29 PMID 18988016 CrossRef
  41. Keen M, Rapson N. Development of a serum-free culture medium for the large scale production of recombinant protein from a Chinese hamster ovary cell line. Cytotechnology. 1995;17:153-63 PMID 22358555 CrossRef
  42. Jayme D, Watanabe T, Shimada T. Basal medium development for serum-free culture: a historical perspective. Cytotechnology. 1997;23:95-101 PMID 22358525 CrossRef
  43. Shah S, Blumen S, Pitha-Rowe I, Kitareewan S, Freemantle S, Feng Q, et al. UBE1L represses PML/RAR{alpha} by targeting the PML domain for ISG15ylation. Mol Cancer Ther. 2008;7:905-14 PMID 18413804 CrossRef
  44. Schulz C, Gomez Perdiguero E, Chorro L, Szabo-Rogers H, Cagnard N, Kierdorf K, et al. A lineage of myeloid cells independent of Myb and hematopoietic stem cells. Science. 2012;336:86-90 PMID 22442384 CrossRef
  45. Di Certo M, Batassa E, Casella I, Serafino A, Floridi A, Passananti C, et al. Delayed internalization and lack of recycling in a beta2-adrenergic receptor fused to the G protein alpha-subunit. BMC Cell Biol. 2008;9:56 PMID 18840275 CrossRef
  46. Kumar P, Bolden G, Arise K, Krazit S, Pandey K. Regulation of natriuretic peptide receptor-A gene expression and stimulation of its guanylate cyclase activity by transcription factor Ets-1. Biosci Rep. 2009;29:57-70 PMID 18651838 CrossRef
  47. Hirota T, Lee J, St John P, Sawa M, Iwaisako K, Noguchi T, et al. Identification of small molecule activators of cryptochrome. Science. 2012;337:1094-7 PMID 22798407 CrossRef
  48. Lamia K, Sachdeva U, DiTacchio L, Williams E, Alvarez J, Egan D, et al. AMPK regulates the circadian clock by cryptochrome phosphorylation and degradation. Science. 2009;326:437-40 PMID 19833968 CrossRef
  49. Mauger D, Lin C, Garcia-Blanco M. hnRNP H and hnRNP F complex with Fox2 to silence fibroblast growth factor receptor 2 exon IIIc. Mol Cell Biol. 2008;28:5403-19 PMID 18573884 CrossRef
  50. Kitareewan S, Blumen S, Sekula D, Bissonnette R, Lamph W, Cui Q, et al. G0S2 is an all-trans-retinoic acid target gene. Int J Oncol. 2008;33:397-404 PMID 18636162
  51. Hokaiwado N, Takeshita F, Naiki-Ito A, Asamoto M, Ochiya T, Shirai T. Glutathione S-transferase Pi mediates proliferation of androgen-independent prostate cancer cells. Carcinogenesis. 2008;29:1134-8 PMID 18413363 CrossRef
  52. Corps A, Jones G, Harrall R, Curry V, Hazleman B, Riley G. The regulation of aggrecanase ADAMTS-4 expression in human Achilles tendon and tendon-derived cells. Matrix Biol. 2008;27:393-401 PMID 18387286 CrossRef
  53. Tagliabracci V, Engel J, Wen J, Wiley S, Worby C, Kinch L, et al. Secreted kinase phosphorylates extracellular proteins that regulate biomineralization. Science. 2012;336:1150-3 PMID 22582013 CrossRef
  54. Liu Y, Li N, You L, Liu X, Li H, Wang X. HSP70 is associated with endothelial activation in placental vascular diseases. Mol Med. 2008;14:561-6 PMID 18372927 CrossRef
  55. Zhou B, Liu J, Wang Q, Liu X, Li X, Li P, et al. The nucleocapsid protein of severe acute respiratory syndrome coronavirus inhibits cell cytokinesis and proliferation by interacting with translation elongation factor 1alpha. J Virol. 2008;82:6962-71 PMID 18448518 CrossRef
  56. Dilly A, Rajala R. Insulin growth factor 1 receptor/PI3K/AKT survival pathway in outer segment membranes of rod photoreceptors. Invest Ophthalmol Vis Sci. 2008;49:4765-73 PMID 18566464 CrossRef
  57. Zhang D, Fan G, Zhou X, Zhao T, Pasha Z, Xu M, et al. Over-expression of CXCR4 on mesenchymal stem cells augments myoangiogenesis in the infarcted myocardium. J Mol Cell Cardiol. 2008;44:281-92 PMID 18201717 CrossRef
  58. Zhang S, MacDonald K, Baguma-Nibasheka M, Geldenhuys L, Casson A, Murphy P. Alternative splicing and differential subcellular localization of the rat FGF antisense gene product. BMC Mol Biol. 2008;9:10 PMID 18215310 CrossRef
  59. Ahn S, Byun K, Cho K, Kim J, Yoo J, Kim D, et al. Human microglial cells synthesize albumin in brain. PLoS ONE. 2008;3:e2829 PMID 18665237 CrossRef
  60. Walker M, Brown R, Cronin T, Robinson P. Photochemistry of retinal chromophore in mouse melanopsin. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:8861-5 PMID 18579788 CrossRef
  61. Misawa T, Arima K, Mizusawa H, Satoh J. Close association of water channel AQP1 with amyloid-beta deposition in Alzheimer disease brains. Acta Neuropathol. 2008;116:247-60 PMID 18509662 CrossRef
  62. Panigone S, Hsieh M, Fu M, Persani L, Conti M. Luteinizing hormone signaling in preovulatory follicles involves early activation of the epidermal growth factor receptor pathway. Mol Endocrinol. 2008;22:924-36 PMID 18187604 CrossRef
  63. Nerenz R, Martowicz M, Pike J. An enhancer 20 kilobases upstream of the human receptor activator of nuclear factor-kappaB ligand gene mediates dominant activation by 1,25-dihydroxyvitamin D3. Mol Endocrinol. 2008;22:1044-56 PMID 18202151 CrossRef
  64. Sonnberg S, Seet B, Pawson T, Fleming S, Mercer A. Poxvirus ankyrin repeat proteins are a unique class of F-box proteins that associate with cellular SCF1 ubiquitin ligase complexes. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:10955-60 PMID 18667692 CrossRef
  65. Kerkis I, Ambrosio C, Kerkis A, Martins D, Zucconi E, Fonseca S, et al. Early transplantation of human immature dental pulp stem cells from baby teeth to golden retriever muscular dystrophy (GRMD) dogs: Local or systemic?. J Transl Med. 2008;6:35 PMID 18598348 CrossRef
  66. Ausseil J, Desmaris N, Bigou S, Attali R, Corbineau S, Vitry S, et al. Early neurodegeneration progresses independently of microglial activation by heparan sulfate in the brain of mucopolysaccharidosis IIIB mice. PLoS ONE. 2008;3:e2296 PMID 18509511 CrossRef
  67. Schneider A, Garlick J, Egles C. Self-assembling peptide nanofiber scaffolds accelerate wound healing. PLoS ONE. 2008;3:e1410 PMID 18183291 CrossRef
  68. Southwell A, Khoshnan A, Dunn D, Bugg C, Lo D, Patterson P. Intrabodies binding the proline-rich domains of mutant huntingtin increase its turnover and reduce neurotoxicity. J Neurosci. 2008;28:9013-20 PMID 18768695 CrossRef
  69. Maitra R, Clement C, Crisi G, Cobelli N, Santambrogio L. Immunogenecity of modified alkane polymers is mediated through TLR1/2 activation. PLoS ONE. 2008;3:e2438 PMID 18560588 CrossRef
  70. Nettles K, Gil G, Nowak J, Métivier R, Sharma V, Greene G. CBP Is a dosage-dependent regulator of nuclear factor-kappaB suppression by the estrogen receptor. Mol Endocrinol. 2008;22:263-72 PMID 17932106
  71. Konigshoff M, Balsara N, Pfaff E, Kramer M, Chrobak I, Seeger W, et al. Functional Wnt signaling is increased in idiopathic pulmonary fibrosis. PLoS ONE. 2008;3:e2142 PMID 18478089 CrossRef
  72. Wang B, Wei H, Yuan J, Li Q, Li Y, Li N, et al. Identification of a surface protein from Lactobacillus reuteri JCM1081 that adheres to porcine gastric mucin and human enterocyte-like HT-29 cells. Curr Microbiol. 2008;57:33-8 PMID 18379843 CrossRef
  73. Peralta-Ramirez J, Hernandez J, Manning-Cela R, Luna-Munoz J, Garcia-Tovar C, Nougayrede J, et al. EspF Interacts with nucleation-promoting factors to recruit junctional proteins into pedestals for pedestal maturation and disruption of paracellular permeability. Infect Immun. 2008;76:3854-68 PMID 18559425 CrossRef
  74. Horvath E, Tackett L, McCarthy A, Raman P, Brozinick J, Elmendorf J. Antidiabetogenic effects of chromium mitigate hyperinsulinemia-induced cellular insulin resistance via correction of plasma membrane cholesterol imbalance. Mol Endocrinol. 2008;22:937-50 PMID 18165437 CrossRef
  75. Naderi A, Hughes-Davies L. A functionally significant cross-talk between androgen receptor and ErbB2 pathways in estrogen receptor negative breast cancer. Neoplasia. 2008;10:542-8 PMID 18516291
  76. Giannopoulou M, Dai C, Tan X, Wen X, Michalopoulos G, Liu Y. Hepatocyte growth factor exerts its anti-inflammatory action by disrupting nuclear factor-kappaB signaling. Am J Pathol. 2008;173:30-41 PMID 18502824 CrossRef
  77. Yasuoka H, Kodama R, Hirokawa M, Takamura Y, Miyauchi A, Sanke T, et al. CXCR4 expression in papillary thyroid carcinoma: induction by nitric oxide and correlation with lymph node metastasis. BMC Cancer. 2008;8:274 PMID 18826577 CrossRef
  78. Mazurkiewicz P, Thomas J, Thompson J, Liu M, Arbibe L, Sansonetti P, et al. SpvC is a Salmonella effector with phosphothreonine lyase activity on host mitogen-activated protein kinases. Mol Microbiol. 2008;67:1371-83 PMID 18284579 CrossRef
  79. Xu L, Xiao N, Liu F, Ren H, Gu J. Inhibition of RIG-I and MDA5-dependent antiviral response by gC1qR at mitochondria. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:1530-5 PMID 19164550 CrossRef
  80. Fallon J, Baker M, Xiong L, Loy R, Yang G, Dirksen R, et al. Crystal structure of dimeric cardiac L-type calcium channel regulatory domains bridged by Ca2+* calmodulins. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:5135-40 PMID 19279214 CrossRef
  81. Shao G, Patterson-Fortin J, Messick T, Feng D, Shanbhag N, Wang Y, et al. MERIT40 controls BRCA1-Rap80 complex integrity and recruitment to DNA double-strand breaks. Genes Dev. 2009;23:740-54 PMID 19261746 CrossRef
  82. Kodani A, Kristensen I, Huang L, Sutterlin C. GM130-dependent control of Cdc42 activity at the Golgi regulates centrosome organization. Mol Biol Cell. 2009;20:1192-200 PMID 19109421 CrossRef
  83. Kam Y, Quaranta V. Cadherin-bound beta-catenin feeds into the Wnt pathway upon adherens junctions dissociation: evidence for an intersection between beta-catenin pools. PLoS ONE. 2009;4:e4580 PMID 19238201 CrossRef
  84. Scorah J, McGowan C. Claspin and Chk1 regulate replication fork stability by different mechanisms. Cell Cycle. 2009;8:1036-43 PMID 19270516
  85. Chabot C, Spring K, Gratton J, Elchebly M, Royal I. New role for the protein tyrosine phosphatase DEP-1 in Akt activation and endothelial cell survival. Mol Cell Biol. 2009;29:241-53 PMID 18936167 CrossRef
  86. Franklin B, Parroche P, Ataíde M, Lauw F, Ropert C, de Oliveira R, et al. Malaria primes the innate immune response due to interferon-gamma induced enhancement of toll-like receptor expression and function. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:5789-94 PMID 19297619 CrossRef
  87. Honda M, Eriksson K, Zhang S, Tanaka S, Lin L, Salehi A, et al. IGFBP3 colocalizes with and regulates hypocretin (orexin). PLoS ONE. 2009;4:e4254 PMID 19158946 CrossRef
  88. Mitchell R, Lee S, Randazzo W, Simmons Z, Connor J. Influence of HFE variants and cellular iron on monocyte chemoattractant protein-1. J Neuroinflammation. 2009;6:6 PMID 19228389 CrossRef
  89. Icard V, Diaz O, Scholtes C, Perrin-Cocon L, Ramière C, Bartenschlager R, et al. Secretion of hepatitis C virus envelope glycoproteins depends on assembly of apolipoprotein B positive lipoproteins. PLoS ONE. 2009;4:e4233 PMID 19156195 CrossRef
  90. Seder C, Hartojo W, Lin L, Silvers A, Wang Z, Thomas D, et al. Upregulated INHBA expression may promote cell proliferation and is associated with poor survival in lung adenocarcinoma. Neoplasia. 2009;11:388-96 PMID 19308293
  91. Kitamura N, Araya R, Kudoh M, Kishida H, Kimura T, Murayama M, et al. Beneficial effects of estrogen in a mouse model of cerebrovascular insufficiency. PLoS ONE. 2009;4:e5159 PMID 19357782 CrossRef
  92. Holt I, Jacquemin V, Fardaei M, Sewry C, Butler-Browne G, Furling D, et al. Muscleblind-like proteins: similarities and differences in normal and myotonic dystrophy muscle. Am J Pathol. 2009;174:216-27 PMID 19095965 CrossRef
  93. Kim S, Hur W, Choi J, Kim D, Wang J, Yoon H, et al. Functional characterization of human oncoprotein gankyrin in Zebrafish. Exp Mol Med. 2009;41:8-16 PMID 19287195
  94. Takikita S, Myerowitz R, Zaal K, Raben N, Plotz P. Murine muscle cell models for Pompe disease and their use in studying therapeutic approaches. Mol Genet Metab. 2009;96:208-17 PMID 19167256 CrossRef
  95. Efeyan A, Murga M, Martinez-Pastor B, Ortega-Molina A, Soria R, Collado M, et al. Limited role of murine ATM in oncogene-induced senescence and p53-dependent tumor suppression. PLoS ONE. 2009;4:e5475 PMID 19421407 CrossRef
  96. Berger K, Lindh R, Wierup N, Zmuda-Trzebiatowska E, Lindqvist A, Manganiello V, et al. Phosphodiesterase 3B is localized in caveolae and smooth ER in mouse hepatocytes and is important in the regulation of glucose and lipid metabolism. PLoS ONE. 2009;4:e4671 PMID 19262749 CrossRef
  97. Galvez A, Duran A, Linares J, Pathrose P, Castilla E, Abu-Baker S, et al. Protein kinase Czeta represses the interleukin-6 promoter and impairs tumorigenesis in vivo. Mol Cell Biol. 2009;29:104-15 PMID 18955501 CrossRef
  98. Leaner V, Chick J, Donninger H, Linniola I, Mendoza A, Khanna C, et al. Inhibition of AP-1 transcriptional activity blocks the migration, invasion, and experimental metastasis of murine osteosarcoma. Am J Pathol. 2009;174:265-75 PMID 19074613 CrossRef
  99. Maklad A, Nicolai J, Bichsel K, Evenson J, Lee T, Threadgill D, et al. The EGFR is required for proper innervation to the skin. J Invest Dermatol. 2009;129:690-8 PMID 18830272 CrossRef
  100. Guzman-Ayala M, Lee K, Mavrakis K, Goggolidou P, Norris D, Episkopou V. Graded Smad2/3 activation is converted directly into levels of target gene expression in embryonic stem cells. PLoS ONE. 2009;4:e4268 PMID 19172185 CrossRef
  101. Martín Caballero I, Hansen J, Leaford D, Pollard S, Hendrich B. The methyl-CpG binding proteins Mecp2, Mbd2 and Kaiso are dispensable for mouse embryogenesis, but play a redundant function in neural differentiation. PLoS ONE. 2009;4:e4315 PMID 19177165 CrossRef
  102. Wang W, Pan H, Murray K, Jefferson B, Li Y. Matrix metalloproteinase-1 promotes muscle cell migration and differentiation. Am J Pathol. 2009;174:541-9 PMID 19147819 CrossRef
  103. Maciejewska I, Qin D, Huang B, Sun Y, Mues G, Svoboda K, et al. Distinct compartmentalization of dentin matrix protein 1 fragments in mineralized tissues and cells. Cells Tissues Organs. 2009;189:186-91 PMID 18698129 CrossRef
  104. Lee Y, Lan Tran H, Van Ta Q. Regulation of expression of matrix metalloproteinase-9 by JNK in Raw 264.7 cells: presence of inhibitory factor(s) suppressing MMP-9 induction in serum and conditioned media. Exp Mol Med. 2009;41:259-68 PMID 19299915 CrossRef
  105. Kepp O, Gottschalk K, Churin Y, Rajalingam K, Brinkmann V, Machuy N, et al. Bim and Bmf synergize to induce apoptosis in Neisseria gonorrhoeae infection. PLoS Pathog. 2009;5:e1000348 PMID 19300516 CrossRef
  106. Hernanz-Falcón P, Joffre O, Williams D, Reis E Sousa C. Internalization of Dectin-1 terminates induction of inflammatory responses. Eur J Immunol. 2009;39:507-13 PMID 19130473 CrossRef
  107. Granja A, Sánchez E, Sabina P, Fresno M, Revilla Y. African swine fever virus blocks the host cell antiviral inflammatory response through a direct inhibition of PKC-theta-mediated p300 transactivation. J Virol. 2009;83:969-80 PMID 19004945 CrossRef
  108. Li F, Ravetch J. Inhibitory Fcγ receptor engagement drives adjuvant and anti-tumor activities of agonistic CD40 antibodies. Science. 2011;333:1030-4 PMID 21852502 CrossRef
  109. Moon B, Yoon J, Kim M, Lee S, Choi T, Choi K. Bone morphogenetic protein 4 stimulates neuronal differentiation of neuronal stem cells through the ERK pathway. Exp Mol Med. 2009;41:116-25 PMID 19287192
  110. Ye H, Daoud-El Baba M, Peng R, Fussenegger M. A synthetic optogenetic transcription device enhances blood-glucose homeostasis in mice. Science. 2011;332:1565-8 PMID 21700876 CrossRef
  111. Marschner K, Kollmann K, Schweizer M, Braulke T, Pohl S. A key enzyme in the biogenesis of lysosomes is a protease that regulates cholesterol metabolism. Science. 2011;333:87-90 PMID 21719679 CrossRef
  112. Paige J, Wu K, Jaffrey S. RNA mimics of green fluorescent protein. Science. 2011;333:642-6 PMID 21798953 CrossRef
  113. Hussain K, Challis B, Rocha N, Payne F, Minic M, Thompson A, et al. An activating mutation of AKT2 and human hypoglycemia. Science. 2011;334:474 PMID 21979934 CrossRef
  114. Anastasiou D, Poulogiannis G, Asara J, Boxer M, Jiang J, Shen M, et al. Inhibition of pyruvate kinase M2 by reactive oxygen species contributes to cellular antioxidant responses. Science. 2011;334:1278-83 PMID 22052977 CrossRef
  115. Meister S, Plouffe D, Kuhen K, Bonamy G, Wu T, Barnes S, et al. Imaging of Plasmodium liver stages to drive next-generation antimalarial drug discovery. Science. 2011;334:1372-7 PMID 22096101 CrossRef
  116. Szijgyarto Z, Garedew A, Azevedo C, Saiardi A. Influence of inositol pyrophosphates on cellular energy dynamics. Science. 2011;334:802-5 PMID 22076377 CrossRef
  117. Kessler J, Kahle K, Sun T, Meerbrey K, Schlabach M, Schmitt E, et al. A SUMOylation-dependent transcriptional subprogram is required for Myc-driven tumorigenesis. Science. 2012;335:348-53 PMID 22157079 CrossRef
  118. Modi B, Neustadter J, Binda E, Lewis J, Filler R, Roberts S, et al. Langerhans cells facilitate epithelial DNA damage and squamous cell carcinoma. Science. 2012;335:104-8 PMID 22223807 CrossRef
  119. Chu H, Pazgier M, Jung G, Nuccio S, Castillo P, de Jong M, et al. Human α-defensin 6 promotes mucosal innate immunity through self-assembled peptide nanonets. Science. 2012;337:477-81 PMID 22722251 CrossRef
  120. Fang S, Wei J, Pentinmikko N, Leinonen H, Salven P. Generation of functional blood vessels from a single c-kit+ adult vascular endothelial stem cell. PLoS Biol. 2012;10:e1001407 PMID 23091420 CrossRef
  121. Higashida K, Kim S, Jung S, Asaka M, Holloszy J, Han D. Effects of resveratrol and SIRT1 on PGC-1α activity and mitochondrial biogenesis: a reevaluation. PLoS Biol. 2013;11:e1001603 PMID 23874150 CrossRef
  122. Ehehalt R, Sparla R, Kulaksiz H, Herrmann T, Fullekrug J, Stremmel W. Uptake of long chain fatty acids is regulated by dynamic interaction of FAT/CD36 with cholesterol/sphingolipid enriched microdomains (lipid rafts). BMC Cell Biol. 2008;9:45 PMID 18700980 CrossRef
  123. Epting C, King F, Pedersen A, Zaman J, Ritner C, Bernstein H. Stem cell antigen-1 localizes to lipid microdomains and associates with insulin degrading enzyme in skeletal myoblasts. J Cell Physiol. 2008;217:250-60 PMID 18506847 CrossRef
  124. Li Z, Mathew P, Yang J, Starbuck M, Zurita A, Liu J, et al. Androgen receptor-negative human prostate cancer cells induce osteogenesis in mice through FGF9-mediated mechanisms. J Clin Invest. 2008;118:2697-710 PMID 18618013 CrossRef
  125. Yi W, Clark P, Mason D, Keenan M, Hill C, Goddard W, et al. Phosphofructokinase 1 glycosylation regulates cell growth and metabolism. Science. 2012;337:975-80 PMID 22923583 CrossRef
  126. Yang N, Huang J, Greshock J, Liang S, Barchetti A, Hasegawa K, et al. Transcriptional regulation of PIK3CA oncogene by NF-kappaB in ovarian cancer microenvironment. PLoS ONE. 2008;3:e1758 PMID 18335034 CrossRef
  127. Liang S, Yang N, Pan Y, Deng S, Lin X, Yang X, et al. Expression of activated PIK3CA in ovarian surface epithelium results in hyperplasia but not tumor formation. PLoS ONE. 2009;4:e4295 PMID 19172191 CrossRef
  128. Avinoam O, Fridman K, Valansi C, Abutbul I, Zeev-Ben-Mordehai T, Maurer U, et al. Conserved eukaryotic fusogens can fuse viral envelopes to cells. Science. 2011;332:589-92 PMID 21436398 CrossRef
  129. Puel A, Cypowyj S, Bustamante J, Wright J, Liu L, Lim H, et al. Chronic mucocutaneous candidiasis in humans with inborn errors of interleukin-17 immunity. Science. 2011;332:65-8 PMID 21350122 CrossRef
  130. Delloye-Bourgeois C, Gibert B, Rama N, Delcros J, Gadot N, Scoazec J, et al. Sonic Hedgehog Promotes Tumor Cell Survival by Inhibiting CDON Pro-Apoptotic Activity. PLoS Biol. 2013;11:e1001623 PMID 23940460 CrossRef
  131. Wu C, Sahoo D, Arvanitis C, Bradon N, Dill D, Felsher D. Combined analysis of murine and human microarrays and ChIP analysis reveals genes associated with the ability of MYC to maintain tumorigenesis. PLoS Genet. 2008;4:e1000090 PMID 18535662 CrossRef
  132. Yun J, Rago C, Cheong I, Pagliarini R, Angenendt P, Rajagopalan H, et al. Glucose deprivation contributes to the development of KRAS pathway mutations in tumor cells. Science. 2009;325:1555-9 PMID 19661383 CrossRef
  133. Kansara M, Tsang M, Kodjabachian L, Sims N, Trivett M, Ehrich M, et al. Wnt inhibitory factor 1 is epigenetically silenced in human osteosarcoma, and targeted disruption accelerates osteosarcomagenesis in mice. J Clin Invest. 2009;119:837-51 PMID 19307728 CrossRef
  134. Huang H, Wang S, Yin M, Dong L, Wang C, Wu W, et al. Par-1 regulates tissue growth by influencing hippo phosphorylation status and hippo-salvador association. PLoS Biol. 2013;11:e1001620 PMID 23940457 CrossRef
  135. Topisirovic I, Siddiqui N, Orolicki S, Skrabanek L, Tremblay M, Hoang T, et al. Stability of eukaryotic translation initiation factor 4E mRNA is regulated by HuR, and this activity is dysregulated in cancer. Mol Cell Biol. 2009;29:1152-62 PMID 19114552 CrossRef
  136. Sobolev O, Stern P, Lacy-Hulbert A, Hynes R. Natural killer cells require selectins for suppression of subcutaneous tumors. Cancer Res. 2009;69:2531-9 PMID 19258505 CrossRef
  137. Peng T, Huang B, Sun Y, Lu Y, Bonewald L, Chen S, et al. Blocking of proteolytic processing and deletion of glycosaminoglycan side chain of mouse DMP1 by substituting critical amino acid residues. Cells Tissues Organs. 2009;189:192-7 PMID 18698130 CrossRef
  138. Vijayaragavan K, Szabo E, Bosse M, Ramos-Mejia V, Moon R, Bhatia M. Noncanonical Wnt signaling orchestrates early developmental events toward hematopoietic cell fate from human embryonic stem cells. Cell Stem Cell. 2009;4:248-62 PMID 19265664 CrossRef
  139. Chan C, Lau S, Woo P, Tse H, Zheng B, Chen L, et al. Identification of major histocompatibility complex class I C molecule as an attachment factor that facilitates coronavirus HKU1 spike-mediated infection. J Virol. 2009;83:1026-35 PMID 18987136 CrossRef
  140. Qu X, Metz R, Porter W, Cassone V, Earnest D. Disruption of period gene expression alters the inductive effects of dioxin on the AhR signaling pathway in the mouse liver. Toxicol Appl Pharmacol. 2009;234:370-7 PMID 19038280 CrossRef
  141. Sha Y, Pandit L, Zeng S, Eissa N. A critical role for CHIP in the aggresome pathway. Mol Cell Biol. 2009;29:116-28 PMID 18955503 CrossRef
  142. Tang W, Lu Y, Tian Q, Zhang Y, Guo F, Liu G, et al. The growth factor progranulin binds to TNF receptors and is therapeutic against inflammatory arthritis in mice. Science. 2011;332:478-84 PMID 21393509 CrossRef
  143. Blish K, Wang W, Willingham M, Du W, Birse C, Krishnan S, et al. A human bone morphogenetic protein antagonist is down-regulated in renal cancer. Mol Biol Cell. 2008;19:457-64 PMID 18032587
  144. Stamm I, Mohr M, Bridger P, Schröpfer E, König M, Stoffregen W, et al. Epithelial and mesenchymal cells in the bovine colonic mucosa differ in their responsiveness to Escherichia coli Shiga toxin 1. Infect Immun. 2008;76:5381-91 PMID 18765725 CrossRef
  145. Pattyn E, Verhee A, Uyttendaele I, Piessevaux J, Timmerman E, Gevaert K, et al. HyperISGylation of Old World monkey ISG15 in human cells. PLoS ONE. 2008;3:e2427 PMID 18560560 CrossRef
  146. Chung Y, Troy H, Kristeleit R, Aherne W, Jackson L, Atadja P, et al. Noninvasive magnetic resonance spectroscopic pharmacodynamic markers of a novel histone deacetylase inhibitor, LAQ824, in human colon carcinoma cells and xenografts. Neoplasia. 2008;10:303-13 PMID 18392140
  147. Wall A, Persigehl T, Hauff P, Licha K, Schirner M, Müller S, et al. Differentiation of angiogenic burden in human cancer xenografts using a perfusion-type optical contrast agent (SIDAG). Breast Cancer Res. 2008;10:R23 PMID 18331624 CrossRef
  148. Rauh A, Windischhofer W, Kovacevic A, DeVaney T, Huber E, Semlitsch M, et al. Endothelin (ET)-1 and ET-3 promote expression of c-fos and c-jun in human choriocarcinoma via ET(B) receptor-mediated G(i)- and G(q)-pathways and MAP kinase activation. Br J Pharmacol. 2008;154:13-24 PMID 18362896 CrossRef
  149. Chao K, Chao K, Fu Y, Liu S. Islet-like clusters derived from mesenchymal stem cells in Wharton's Jelly of the human umbilical cord for transplantation to control type 1 diabetes. PLoS ONE. 2008;3:e1451 PMID 18197261 CrossRef
  150. Corlazzoli F, Rossetti S, Bistulfi G, Ren M, Sacchi N. Derangement of a factor upstream of RARalpha triggers the repression of a pleiotropic epigenetic network. PLoS ONE. 2009;4:e4305 PMID 19173001 CrossRef
  151. Meng Y, Gu C, Wu Z, Zhao Y, Si Y, Fu X, et al. Id2 promotes the invasive growth of MCF-7 and SKOV-3 cells by a novel mechanism independent of dimerization to basic helix-loop-helix factors. BMC Cancer. 2009;9:75 PMID 19257909 CrossRef
  152. Rodriguez R, Rubio R, Masip M, Catalina P, Nieto A, de la Cueva T, et al. Loss of p53 induces tumorigenesis in p21-deficient mesenchymal stem cells. Neoplasia. 2009;11:397-407 PMID 19308294
  153. MacPherson M, Beatty L, Zhou W, Du M, Sadowski P. The CTCF insulator protein is posttranslationally modified by SUMO. Mol Cell Biol. 2009;29:714-25 PMID 19029252 CrossRef
  154. Ambagala A, Bosma T, Ali M, Poustovoitov M, Chen J, Gershon M, et al. Varicella-zoster virus immediate-early 63 protein interacts with human antisilencing function 1 protein and alters its ability to bind histones h3.1 and h3.3. J Virol. 2009;83:200-9 PMID 18971269 CrossRef
  155. Goicoechea S, Bednarski B, Garcia-Mata R, Prentice-Dunn H, Kim H, Otey C. Palladin contributes to invasive motility in human breast cancer cells. Oncogene. 2009;28:587-98 PMID 18978809 CrossRef
  156. Daher A, Laraki G, Singh M, Melendez-Peña C, Bannwarth S, Peters A, et al. TRBP control of PACT-induced phosphorylation of protein kinase R is reversed by stress. Mol Cell Biol. 2009;29:254-65 PMID 18936160 CrossRef
  157. Cheong R, Rhee A, Wang C, Nemenman I, Levchenko A. Information transduction capacity of noisy biochemical signaling networks. Science. 2011;334:354-8 PMID 21921160 CrossRef
  158. Yoshida-Moriguchi T, Yu L, Stalnaker S, Davis S, Kunz S, Madson M, et al. O-mannosyl phosphorylation of alpha-dystroglycan is required for laminin binding. Science. 2010;327:88-92 PMID 20044576 CrossRef
  159. Kim Y, Sharov A, McDole K, Cheng M, Hao H, Fan C, et al. Mouse B-type lamins are required for proper organogenesis but not by embryonic stem cells. Science. 2011;334:1706-10 PMID 22116031 CrossRef
  160. Garcia-Gonzalo F, Izpisua Belmonte J. Albumin-associated lipids regulate human embryonic stem cell self-renewal. PLoS ONE. 2008;3:e1384 PMID 18167543 CrossRef
  161. Riby J, Firestone G, Bjeldanes L. 3,3'-diindolylmethane reduces levels of HIF-1alpha and HIF-1 activity in hypoxic cultured human cancer cells. Biochem Pharmacol. 2008;75:1858-67 PMID 18329003 CrossRef
  162. Koinuma D, Tsutsumi S, Kamimura N, Taniguchi H, Miyazawa K, Sunamura M, et al. Chromatin immunoprecipitation on microarray analysis of Smad2/3 binding sites reveals roles of ETS1 and TFAP2A in transforming growth factor beta signaling. Mol Cell Biol. 2009;29:172-86 PMID 18955504 CrossRef
  163. Assadian S, Aliaga A, Del Maestro R, Evans A, Bedell B. FDG-PET imaging for the evaluation of antiglioma agents in a rat model. Neuro Oncol. 2008;10:292-9 PMID 18430796 CrossRef
  164. Hitani K, Yokoo S, Honda N, Usui T, Yamagami S, Amano S. Transplantation of a sheet of human corneal endothelial cell in a rabbit model. Mol Vis. 2008;14:1-9 PMID 18246029
  165. Chuang H, Kardosh A, Gaffney K, Petasis N, Schonthal A. COX-2 inhibition is neither necessary nor sufficient for celecoxib to suppress tumor cell proliferation and focus formation in vitro. Mol Cancer. 2008;7:38 PMID 18485224 CrossRef
  166. Barkan D, Kleinman H, Simmons J, Asmussen H, Kamaraju A, Hoenorhoff M, et al. Inhibition of metastatic outgrowth from single dormant tumor cells by targeting the cytoskeleton. Cancer Res. 2008;68:6241-50 PMID 18676848 CrossRef
  167. Sahin O, Frohlich H, Löbke C, Korf U, Burmester S, Majety M, et al. Modeling ERBB receptor-regulated G1/S transition to find novel targets for de novo trastuzumab resistance. BMC Syst Biol. 2009;3:1 PMID 19118495 CrossRef
  168. Kouzu-Fujita M, Mezaki Y, Sawatsubashi S, Matsumoto T, Yamaoka I, Yano T, et al. Coactivation of estrogen receptor beta by gonadotropin-induced cofactor GIOT-4. Mol Cell Biol. 2009;29:83-92 PMID 18981223 CrossRef
  169. Liton P, Li G, Luna C, Gonzalez P, Epstein D. Cross-talk between TGF-beta1 and IL-6 in human trabecular meshwork cells. Mol Vis. 2009;15:326-34 PMID 19209241
  170. Fichorova R, Richardson-Harman N, Alfano M, Belec L, Carbonneil C, Chen S, et al. Biological and technical variables affecting immunoassay recovery of cytokines from human serum and simulated vaginal fluid: a multicenter study. Anal Chem. 2008;80:4741-51 PMID 18484740 CrossRef
  171. Kawanami Y, Morimoto Y, Kim H, Nakamura T, Machida K, Kido T, et al. Calcitonin gene-related peptide stimulates proliferation of alveolar epithelial cells. Respir Res. 2009;10:8 PMID 19192276 CrossRef
  172. Doh Y, Kim H, Jung E, Choi S, Kim J, Kim B, et al. Novel LMNA gene mutation in a patient with Atypical Werner's Syndrome. Korean J Intern Med. 2009;24:68-72 PMID 19270485 CrossRef
  173. Zaitseva L, Cherepanov P, Leyens L, Wilson S, Rasaiyaah J, Fassati A. HIV-1 exploits importin 7 to maximize nuclear import of its DNA genome. Retrovirology. 2009;6:11 PMID 19193229 CrossRef
  174. Zhu H, Wu H, Liu X, Evans B, Medina D, Liu C, et al. Role of MicroRNA miR-27a and miR-451 in the regulation of MDR1/P-glycoprotein expression in human cancer cells. Biochem Pharmacol. 2008;76:582-8 PMID 18619946 CrossRef
  175. Liu X, Wang L, Zhang S, Lin J, Zhang S, Feitelson M, et al. Mutations in the C-terminus of the X protein of hepatitis B virus regulate Wnt-5a expression in hepatoma Huh7 cells: cDNA microarray and proteomic analyses. Carcinogenesis. 2008;29:1207-14 PMID 18477650 CrossRef
  176. Marshall L, Moore A, Ohki M, Kitabayashi I, Patterson D, Ornelles D. RUNX1 permits E4orf6-directed nuclear localization of the adenovirus E1B-55K protein and associates with centers of viral DNA and RNA synthesis. J Virol. 2008;82:6395-408 PMID 18417565 CrossRef
  177. Thomas B, Woznica I, Mierke D, Wittelsberger A, Rosenblatt M. Conformational changes in the parathyroid hormone receptor associated with activation by agonist. Mol Endocrinol. 2008;22:1154-62 PMID 18258686 CrossRef
  178. Boutsma E, Noback S, Van Lohuizen M. The Polycomb protein and E3 ubiquitin ligase Ring1B harbors an IRES in its highly conserved 5' UTR. PLoS ONE. 2008;3:e2322 PMID 18523580 CrossRef
  179. Méndez-Samperio P, Miranda E, Trejo A. Expression and secretion of cathelicidin LL-37 in human epithelial cells after infection by Mycobacterium bovis Bacillus Calmette-Guérin. Clin Vaccine Immunol. 2008;15:1450-5 PMID 18579695 CrossRef
  180. Park J, Cawley N, Loh Y. Carboxypeptidase E cytoplasmic tail-driven vesicle transport is key for activity-dependent secretion of peptide hormones. Mol Endocrinol. 2008;22:989-1005 PMID 18202146 CrossRef
  181. Gao J, DeRouen M, Chen C, Nguyen M, Nguyen N, Ido H, et al. Laminin-511 is an epithelial message promoting dermal papilla development and function during early hair morphogenesis. Genes Dev. 2008;22:2111-24 PMID 18676816 CrossRef
  182. Urbanska K, Pannizzo P, Lassak A, Gualco E, Surmacz E, Croul S, et al. Estrogen receptor beta-mediated nuclear interaction between IRS-1 and Rad51 inhibits homologous recombination directed DNA repair in medulloblastoma. J Cell Physiol. 2009;219:392-401 PMID 19117011 CrossRef
  183. Feng S, Muraoka-Cook R, Hunter D, Sandahl M, Caskey L, Miyazawa K, et al. The E3 ubiquitin ligase WWP1 selectively targets HER4 and its proteolytically derived signaling isoforms for degradation. Mol Cell Biol. 2009;29:892-906 PMID 19047365 CrossRef
  184. Tsai Y, Wu M, Wu Y, Chang S, Lin S, Sharp T, et al. The M type K15 protein of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus regulates microRNA expression via its SH2-binding motif to induce cell migration and invasion. J Virol. 2009;83:622-32 PMID 18971265 CrossRef
  185. Ramachandran A, Parisien J, Horvath C. STAT2 is a primary target for measles virus V protein-mediated alpha/beta interferon signaling inhibition. J Virol. 2008;82:8330-8 PMID 18579593 CrossRef
  186. Xu M, Luo W, Elzi D, Grandori C, Galloway D. NFX1 interacts with mSin3A/histone deacetylase to repress hTERT transcription in keratinocytes. Mol Cell Biol. 2008;28:4819-28 PMID 18505829 CrossRef
  187. Dettenhofer M, Zhou F, Leder P. Formin 1-isoform IV deficient cells exhibit defects in cell spreading and focal adhesion formation. PLoS ONE. 2008;3:e2497 PMID 18560567 CrossRef
  188. Rao V, Krishnamoorthy R, Yorio T. Endothelin-1 mediated regulation of extracellular matrix collagens in cells of human lamina cribrosa. Exp Eye Res. 2008;86:886-94 PMID 18420197 CrossRef
  189. Akpan N, Caradonna K, Chuenkova M, PereiraPerrin M. Chagas' disease parasite-derived neurotrophic factor activates cholinergic gene expression in neuronal PC12 cells. Brain Res. 2008;1217:195-202 PMID 18502403 CrossRef
  190. Zhu L, Sun G, Zhang H, Zhang Y, Chen X, Jiang X, et al. PGC-1alpha is a key regulator of glucose-induced proliferation and migration in vascular smooth muscle cells. PLoS ONE. 2009;4:e4182 PMID 19142226 CrossRef
  191. Michaud M, Martins I, Sukkurwala A, Adjemian S, Ma Y, Pellegatti P, et al. Autophagy-dependent anticancer immune responses induced by chemotherapeutic agents in mice. Science. 2011;334:1573-7 PMID 22174255 CrossRef
  192. Lange S, Mitchell D, Vasquez K. High mobility group protein B1 enhances DNA repair and chromatin modification after DNA damage. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:10320-5 PMID 18650382 CrossRef
  193. Gallazzini M, Ferraris J, Burg M. GDPD5 is a glycerophosphocholine phosphodiesterase that osmotically regulates the osmoprotective organic osmolyte GPC. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:11026-31 PMID 18667693 CrossRef
  194. Tjabringa G, Bergers M, van Rens D, de Boer R, Lamme E, Schalkwijk J. Development and validation of human psoriatic skin equivalents. Am J Pathol. 2008;173:815-23 PMID 18669614 CrossRef
  195. Zhang C, An J, Strickland D, Yepes M. The low-density lipoprotein receptor-related protein 1 mediates tissue-type plasminogen activator-induced microglial activation in the ischemic brain. Am J Pathol. 2009;174:586-94 PMID 19147818 CrossRef
  196. Smith E, Omerbasic D, Lechner S, Anirudhan G, Lapatsina L, Lewin G. The molecular basis of acid insensitivity in the African naked mole-rat. Science. 2011;334:1557-60 PMID 22174253 CrossRef
  197. Yi C, Ma M, Ran L, Zheng J, Tong J, Zhu J, et al. Function and molecular mechanism of acetylation in autophagy regulation. Science. 2012;336:474-7 PMID 22539722 CrossRef
  198. Niewiadomska A, Gifford R. The extraordinary evolutionary history of the reticuloendotheliosis viruses. PLoS Biol. 2013;11:e1001642 PMID 24013706 CrossRef
  199. Luo X, Zuo X, Zhou Y, Zhang B, Shi Y, Liu M, et al. Extracellular heat shock protein 70 inhibits tumour necrosis factor-alpha induced proinflammatory mediator production in fibroblast-like synoviocytes. Arthritis Res Ther. 2008;10:R41 PMID 18410682 CrossRef
  200. Bowes A, Khan M, Shi Y, Robertson L, Werstuck G. Valproate attenuates accelerated atherosclerosis in hyperglycemic apoE-deficient mice: evidence in support of a role for endoplasmic reticulum stress and glycogen synthase kinase-3 in lesion development and hepatic steatosis. Am J Pathol. 2009;174:330-42 PMID 19095952 CrossRef
  201. Iannetti A, Pacifico F, Acquaviva R, Lavorgna A, Crescenzi E, Vascotto C, et al. The neutrophil gelatinase-associated lipocalin (NGAL), a NF-kappaB-regulated gene, is a survival factor for thyroid neoplastic cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:14058-63 PMID 18768801 CrossRef
  202. Fukazawa N, Yokoyama S, Eiraku M, Kengaku M, Maeda N. Receptor type protein tyrosine phosphatase zeta-pleiotrophin signaling controls endocytic trafficking of DNER that regulates neuritogenesis. Mol Cell Biol. 2008;28:4494-506 PMID 18474614 CrossRef
  203. Li B, Du T, Li H, Gu L, Zhang H, Huang J, et al. Signalling pathways for transactivation by dexmedetomidine of epidermal growth factor receptors in astrocytes and its paracrine effect on neurons. Br J Pharmacol. 2008;154:191-203 PMID 18311185 CrossRef
  204. Picard N, Charbonneau C, Sanchez M, Licznar A, Busson M, Lazennec G, et al. Phosphorylation of activation function-1 regulates proteasome-dependent nuclear mobility and E6-associated protein ubiquitin ligase recruitment to the estrogen receptor beta. Mol Endocrinol. 2008;22:317-30 PMID 17962381
  205. Lavender V, Chong S, Ralphs K, Wolstenholme A, Reaves B. Increasing the expression of calcium-permeable TRPC3 and TRPC7 channels enhances constitutive secretion. Biochem J. 2008;413:437-46 PMID 18452405 CrossRef
  206. Gastaldello S, D'Angelo S, Franzoso S, Fanin M, Angelini C, Betto R, et al. Inhibition of proteasome activity promotes the correct localization of disease-causing alpha-sarcoglycan mutants in HEK-293 cells constitutively expressing beta-, gamma-, and delta-sarcoglycan. Am J Pathol. 2008;173:170-81 PMID 18535179 CrossRef
  207. Zhang Z, Harris D, Pandey V. The FUSE binding protein is a cellular factor required for efficient replication of hepatitis C virus. J Virol. 2008;82:5761-73 PMID 18400844 CrossRef
  208. Guo S, Miyake M, Liu K, Shi H. Specific inhibition of hypoxia inducible factor 1 exaggerates cell injury induced by in vitro ischemia through deteriorating cellular redox environment. J Neurochem. 2009;108:1309-21 PMID 19183269 CrossRef
  209. Kawauchi K, Araki K, Tobiume K, Tanaka N. Loss of p53 enhances catalytic activity of IKKbeta through O-linked beta-N-acetyl glucosamine modification. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:3431-6 PMID 19202066 CrossRef
  210. Tateno M, Kato S, Sakurai T, Nukina N, Takahashi R, Araki T. Mutant SOD1 impairs axonal transport of choline acetyltransferase and acetylcholine release by sequestering KAP3. Hum Mol Genet. 2009;18:942-55 PMID 19088126 CrossRef
  211. He Y, Jones C, Fujiki N, Xu Y, Guo B, Holder J, et al. The transcriptional repressor DEC2 regulates sleep length in mammals. Science. 2009;325:866-70 PMID 19679812 CrossRef
  212. Altman B, Wofford J, Zhao Y, Coloff J, Ferguson E, Wieman H, et al. Autophagy provides nutrients but can lead to Chop-dependent induction of Bim to sensitize growth factor-deprived cells to apoptosis. Mol Biol Cell. 2009;20:1180-91 PMID 19109422 CrossRef
  213. Mahoney C, Morgan M, Harrison A, Humphries M, Bass M. Therapeutic ultrasound bypasses canonical syndecan-4 signaling to activate rac1. J Biol Chem. 2009;284:8898-909 PMID 19147498 CrossRef
  214. Hamanaka R, Bobrovnikova-Marjon E, Ji X, Liebhaber S, Diehl J. PERK-dependent regulation of IAP translation during ER stress. Oncogene. 2009;28:910-20 PMID 19029953 CrossRef
  215. Oshikawa M, Usami R, Kato S. Characterization of the arylsulfatase I (ARSI) gene preferentially expressed in the human retinal pigment epithelium cell line ARPE-19. Mol Vis. 2009;15:482-94 PMID 19262745
  216. Smith J, Clarke P, de Billy E, Workman P. Silencing the cochaperone CDC37 destabilizes kinase clients and sensitizes cancer cells to HSP90 inhibitors. Oncogene. 2009;28:157-69 PMID 18931700 CrossRef
  217. Hammond G, Fischer M, Anderson K, Holdich J, Koteci A, Balla T, et al. PI4P and PI(4,5)P2 are essential but independent lipid determinants of membrane identity. Science. 2012;337:727-30 PMID 22722250 CrossRef
  218. Bansal K, Kapoor N, Narayana Y, Puzo G, Gilleron M, Balaji K. PIM2 Induced COX-2 and MMP-9 expression in macrophages requires PI3K and Notch1 signaling. PLoS ONE. 2009;4:e4911 PMID 19290049 CrossRef
  219. Prosser B, Ward C, Lederer W. X-ROS signaling: rapid mechano-chemo transduction in heart. Science. 2011;333:1440-5 PMID 21903813 CrossRef
  220. Chakraborty S, Mohiyuddin S, Gopinath K, Kumar A. Involvement of TSC genes and differential expression of other members of the mTOR signaling pathway in oral squamous cell carcinoma. BMC Cancer. 2008;8:163 PMID 18538015 CrossRef
  221. Oyama S, Yamakawa H, Sasagawa N, Hosoi Y, Futai E, Ishiura S. Dysbindin-1, a schizophrenia-related protein, functionally interacts with the DNA- dependent protein kinase complex in an isoform-dependent manner. PLoS ONE. 2009;4:e4199 PMID 19142223 CrossRef
  222. Larabee J, DeGiusti K, Regens J, Ballard J. Bacillus anthracis edema toxin activates nuclear glycogen synthase kinase 3beta. Infect Immun. 2008;76:4895-904 PMID 18765729 CrossRef
  223. Choi M, Salanova B, Rolle S, Wellner M, Schneider W, Luft F, et al. Short-term heat exposure inhibits inflammation by abrogating recruitment of and nuclear factor-{kappa}B activation in neutrophils exposed to chemotactic cytokines. Am J Pathol. 2008;172:367-777 PMID 18187571 CrossRef
  224. Amsili S, Zer H, Hinderlich S, Krause S, Becker-Cohen M, MacArthur D, et al. UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase (GNE) binds to alpha-actinin 1: novel pathways in skeletal muscle?. PLoS ONE. 2008;3:e2477 PMID 18560563 CrossRef
  225. Jahoor A, Patel R, Bryan A, Do C, Krier J, Watters C, et al. Peroxisome proliferator-activated receptors mediate host cell proinflammatory responses to Pseudomonas aeruginosa autoinducer. J Bacteriol. 2008;190:4408-15 PMID 18178738 CrossRef
  226. Reimer J, Backovic M, Deshpande C, Jardetzky T, Longnecker R. Analysis of Epstein-Barr virus glycoprotein B functional domains via linker insertion mutagenesis. J Virol. 2009;83:734-47 PMID 18987135 CrossRef
  227. Wang H, Westin L, Nong Y, Birnbaum S, Bendor J, Brismar H, et al. Norbin is an endogenous regulator of metabotropic glutamate receptor 5 signaling. Science. 2009;326:1554-7 PMID 20007903 CrossRef
  228. Luheshi N, Rothwell N, Brough D. The dynamics and mechanisms of interleukin-1alpha and beta nuclear import. Traffic. 2009;10:16-25 PMID 18939951 CrossRef
  229. Wilson J, de Sessions P, Leon M, Scholle F. West Nile virus nonstructural protein 1 inhibits TLR3 signal transduction. J Virol. 2008;82:8262-71 PMID 18562533 CrossRef
  230. Meunier J, Russell R, Engle R, Faulk K, Purcell R, Emerson S. Apolipoprotein c1 association with hepatitis C virus. J Virol. 2008;82:9647-56 PMID 18667498 CrossRef
  231. Hein J, Boichuk S, Wu J, Cheng Y, Freire R, Jat P, et al. Simian virus 40 large T antigen disrupts genome integrity and activates a DNA damage response via Bub1 binding. J Virol. 2009;83:117-27 PMID 18922873 CrossRef
  232. Shankarling G, Coates P, Dass B, MacDonald C. A family of splice variants of CstF-64 expressed in vertebrate nervous systems. BMC Mol Biol. 2009;10:22 PMID 19284619 CrossRef
  233. Mancia F, Assur Z, Herman A, Siegel R, Hendrickson W. Ligand sensitivity in dimeric associations of the serotonin 5HT2c receptor. EMBO Rep. 2008;9:363-9 PMID 18344975 CrossRef
  234. Iqbal J, Dai K, Seimon T, Jungreis R, Oyadomari M, Kuriakose G, et al. IRE1beta inhibits chylomicron production by selectively degrading MTP mRNA. Cell Metab. 2008;7:445-55 PMID 18460335 CrossRef
  235. Beauvais D, Ell B, McWhorter A, Rapraeger A. Syndecan-1 regulates alphavbeta3 and alphavbeta5 integrin activation during angiogenesis and is blocked by synstatin, a novel peptide inhibitor. J Exp Med. 2009;206:691-705 PMID 19255147 CrossRef
  236. Liu B, Du H, Rutkowski R, Gartner A, Wang X. LAAT-1 is the lysosomal lysine/arginine transporter that maintains amino acid homeostasis. Science. 2012;337:351-4 PMID 22822152 CrossRef
  237. Johnson K, Zhu S, Tremblay M, Payette J, Wang J, Bouchez L, et al. A stem cell-based approach to cartilage repair. Science. 2012;336:717-21 PMID 22491093 CrossRef
  238. Salahudeen A, Thompson J, Ruiz J, Ma H, Kinch L, Li Q, et al. An E3 ligase possessing an iron-responsive hemerythrin domain is a regulator of iron homeostasis. Science. 2009;326:722-6 PMID 19762597 CrossRef
  239. Janssen A, van der Burg M, Szuhai K, Kops G, Medema R. Chromosome segregation errors as a cause of DNA damage and structural chromosome aberrations. Science. 2011;333:1895-8 PMID 21960636 CrossRef
  240. Herfst S, Schrauwen E, Linster M, Chutinimitkul S, de Wit E, Munster V, et al. Airborne transmission of influenza A/H5N1 virus between ferrets. Science. 2012;336:1534-41 PMID 22723413 CrossRef
  241. Ferdous Z, Lazaro L, Iozzo R, Hook M, Grande-Allen K. Influence of cyclic strain and decorin deficiency on 3D cellularized collagen matrices. Biomaterials. 2008;29:2740-8 PMID 18394699 CrossRef
  242. De Arcangelis V, Soto D, Xiang Y. Phosphodiesterase 4 and phosphatase 2A differentially regulate cAMP/protein kinase a signaling for cardiac myocyte contraction under stimulation of beta1 adrenergic receptor. Mol Pharmacol. 2008;74:1453-62 PMID 18703669 CrossRef
  243. Wen J, Li R, Lu Y, Shupnik M. Decreased BRCA1 confers tamoxifen resistance in breast cancer cells by altering estrogen receptor-coregulator interactions. Oncogene. 2009;28:575-86 PMID 18997820 CrossRef
  244. Lee K, Qian D, Rey S, Wei H, Liu J, Semenza G. Anthracycline chemotherapy inhibits HIF-1 transcriptional activity and tumor-induced mobilization of circulating angiogenic cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:2353-8 PMID 19168635 CrossRef
  245. Das S, Eder S, Schauer S, Diwoky C, Temmel H, Guertl B, et al. Adipose triglyceride lipase contributes to cancer-associated cachexia. Science. 2011;333:233-8 PMID 21680814 CrossRef
  246. Schmidt S, Hommel A, Gawlik V, Augustin R, Junicke N, Florian S, et al. Essential role of glucose transporter GLUT3 for post-implantation embryonic development. J Endocrinol. 2009;200:23-33 PMID 18948350 CrossRef
  247. Heckel T, Czupalla C, Expirto Santo A, Anitei M, Arantzazu Sanchez-Fernandez M, Mosch K, et al. Src-dependent repression of ARF6 is required to maintain podosome-rich sealing zones in bone-digesting osteoclasts. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:1451-6 PMID 19164586 CrossRef
  248. George J, Braun A, Brusko T, Joseph R, Bolisetty S, Wasserfall C, et al. Suppression by CD4+CD25+ regulatory T cells is dependent on expression of heme oxygenase-1 in antigen-presenting cells. Am J Pathol. 2008;173:154-60 PMID 18511516 CrossRef
  249. Zoncu R, Bar-Peled L, Efeyan A, Wang S, Sancak Y, Sabatini D. mTORC1 senses lysosomal amino acids through an inside-out mechanism that requires the vacuolar H(+)-ATPase. Science. 2011;334:678-83 PMID 22053050 CrossRef
  250. Chung S, Kim M, Youn B, Lee N, Park J, Lee I, et al. Glutathione peroxidase 3 mediates the antioxidant effect of peroxisome proliferator-activated receptor gamma in human skeletal muscle cells. Mol Cell Biol. 2009;29:20-30 PMID 18936159 CrossRef
  251. Bassetti M, White J, Kappler J, Marrack P. Transgenic Bcl-3 slows T cell proliferation. Int Immunol. 2009;21:339-48 PMID 19208752 CrossRef
  252. Faivre E, Daniel A, Hillard C, Lange C. Progesterone receptor rapid signaling mediates serine 345 phosphorylation and tethering to specificity protein 1 transcription factors. Mol Endocrinol. 2008;22:823-37 PMID 18202149 CrossRef
  253. Mao Z, Hine C, Tian X, Van Meter M, Au M, Vaidya A, et al. SIRT6 promotes DNA repair under stress by activating PARP1. Science. 2011;332:1443-6 PMID 21680843 CrossRef
  254. Auffray C, Fogg D, Narni-Mancinelli E, Senechal B, Trouillet C, Saederup N, et al. CX3CR1+ CD115+ CD135+ common macrophage/DC precursors and the role of CX3CR1 in their response to inflammation. J Exp Med. 2009;206:595-606 PMID 19273628 CrossRef
  255. Kami D, Shiojima I, Makino H, Matsumoto K, Takahashi Y, Ishii R, et al. Gremlin enhances the determined path to cardiomyogenesis. PLoS ONE. 2008;3:e2407 PMID 18545679 CrossRef
  256. Samee N, Geoffroy V, Marty C, Schiltz C, Vieux-Rochas M, Levi G, et al. Dlx5, a positive regulator of osteoblastogenesis, is essential for osteoblast-osteoclast coupling. Am J Pathol. 2008;173:773-80 PMID 18669617 CrossRef
  257. Gatto M, Drudi-Metalli V, Torrice A, Alpini G, Cantafora A, Blotta I, et al. Insulin-like growth factor-1 isoforms in rat hepatocytes and cholangiocytes and their involvement in protection against cholestatic injury. Lab Invest. 2008;88:986-94 PMID 18607346 CrossRef
  258. Zhang Q, Guo R, Schwarz E, Boyce B, Xing L. TNF inhibits production of stromal cell-derived factor 1 by bone stromal cells and increases osteoclast precursor mobilization from bone marrow to peripheral blood. Arthritis Res Ther. 2008;10:R37 PMID 18371213 CrossRef
  259. Su Y, Sugiura K, Sun F, Pendola J, Cox G, Handel M, et al. MARF1 regulates essential oogenic processes in mice. Science. 2012;335:1496-9 PMID 22442484 CrossRef
  260. Grespin M, Bonamy G, Roggero V, Cameron N, Adam L, Atchison A, et al. Thyroid hormone receptor alpha1 follows a cooperative CRM1/calreticulin-mediated nuclear export pathway. J Biol Chem. 2008;283:25576-88 PMID 18641393 CrossRef
  261. de Jesus Perez V, Alastalo T, Wu J, Axelrod J, Cooke J, Amieva M, et al. Bone morphogenetic protein 2 induces pulmonary angiogenesis via Wnt-beta-catenin and Wnt-RhoA-Rac1 pathways. J Cell Biol. 2009;184:83-99 PMID 19139264 CrossRef
  262. Vij N, Mazur S, Zeitlin P. CFTR is a negative regulator of NFkappaB mediated innate immune response. PLoS ONE. 2009;4:e4664 PMID 19247502 CrossRef
  263. de Frutos C, Dacquin R, Vega S, Jurdic P, Machuca-Gayet I, Nieto M. Snail1 controls bone mass by regulating Runx2 and VDR expression during osteoblast differentiation. EMBO J. 2009;28:686-96 PMID 19197242 CrossRef
  264. Park S, Rich J, Hanses F, Lee J. Defects in innate immunity predispose C57BL/6J-Leprdb/Leprdb mice to infection by Staphylococcus aureus. Infect Immun. 2009;77:1008-14 PMID 19103772 CrossRef
  265. Narita M, Young A, Arakawa S, Samarajiwa S, Nakashima T, Yoshida S, et al. Spatial coupling of mTOR and autophagy augments secretory phenotypes. Science. 2011;332:966-70 PMID 21512002 CrossRef
  266. Wang W, Li G, Chen C, Xie X, Zhuang X. Chromosome organization by a nucleoid-associated protein in live bacteria. Science. 2011;333:1445-9 PMID 21903814 CrossRef
  267. Chetty C, Lakka S, Bhoopathi P, Kunigal S, Geiss R, Rao J. Tissue inhibitor of metalloproteinase 3 suppresses tumor angiogenesis in matrix metalloproteinase 2-down-regulated lung cancer. Cancer Res. 2008;68:4736-45 PMID 18559520 CrossRef
  268. Chen Y, Honeychurch K, Yang G, Byrd C, Harver C, Hruby D, et al. Vaccinia virus p37 interacts with host proteins associated with LE-derived transport vesicle biogenesis. Virol J. 2009;6:44 PMID 19400954 CrossRef
  269. Li M, Wang I, Li Y, Bruzel A, Richards A, Toung J, et al. Widespread RNA and DNA sequence differences in the human transcriptome. Science. 2011;333:53-8 PMID 21596952 CrossRef
  270. Verma V, Sauer T, Chan C, Zhou M, Zhang C, Maminishkis A, et al. Constancy of ERp29 expression in cultured retinal pigment epithelial cells in the Ccl2/Cx3cr1 deficient mouse model of age-related macular degeneration. Curr Eye Res. 2008;33:701-7 PMID 18696346 CrossRef
  271. Chamberlain S, Yee D, Magnuson T. Polycomb repressive complex 2 is dispensable for maintenance of embryonic stem cell pluripotency. Stem Cells. 2008;26:1496-505 PMID 18403752 CrossRef
  272. Castilow E, Olson M, Meyerholz D, Varga S. Differential role of gamma interferon in inhibiting pulmonary eosinophilia and exacerbating systemic disease in fusion protein-immunized mice undergoing challenge infection with respiratory syncytial virus. J Virol. 2008;82:2196-207 PMID 18094193
  273. Wu K, Wang H, Hong S. Mechanism of mitomycin-induced apoptosis in cultured corneal endothelial cells. Mol Vis. 2008;14:1705-12 PMID 18806879
  274. Fujita T, Liu W, Doihara H, Wan Y. Regulation of Skp2-p27 axis by the Cdh1/anaphase-promoting complex pathway in colorectal tumorigenesis. Am J Pathol. 2008;173:217-28 PMID 18535175 CrossRef
  275. Cruz-Migoni A, Hautbergue G, Artymiuk P, Baker P, Bokori-Brown M, Chang C, et al. A Burkholderia pseudomallei toxin inhibits helicase activity of translation factor eIF4A. Science. 2011;334:821-4 PMID 22076380 CrossRef
  276. Carbone D, Moreno J, Tjalkens R. Nuclear factor kappa-B mediates selective induction of neuronal nitric oxide synthase in astrocytes during low-level inflammatory stimulation with MPTP. Brain Res. 2008;1217:1-9 PMID 18508038 CrossRef
  277. Sen S, Talukdar I, Webster N. SRp20 and CUG-BP1 modulate insulin receptor exon 11 alternative splicing. Mol Cell Biol. 2009;29:871-80 PMID 19047369 CrossRef
  278. Howlin J, Rosenkvist J, Andersson T. TNK2 preserves epidermal growth factor receptor expression on the cell surface and enhances migration and invasion of human breast cancer cells. Breast Cancer Res. 2008;10:R36 PMID 18435854 CrossRef
  279. Provance D, Addison E, Wood P, Chen D, Silan C, Mercer J. Myosin-Vb functions as a dynamic tether for peripheral endocytic compartments during transferrin trafficking. BMC Cell Biol. 2008;9:44 PMID 18687135 CrossRef
  280. Berman S, Chen Y, Qi B, McCaffery J, Rucker E, Goebbels S, et al. Bcl-x L increases mitochondrial fission, fusion, and biomass in neurons. J Cell Biol. 2009;184:707-19 PMID 19255249 CrossRef
  281. Kuiper J, van Horssen R, Oerlemans F, Peters W, van Dommelen M, te Lindert M, et al. Local ATP generation by brain-type creatine kinase (CK-B) facilitates cell motility. PLoS ONE. 2009;4:e5030 PMID 19333390 CrossRef
  282. Czupryn A, Zhou Y, Chen X, McNay D, Anderson M, Flier J, et al. Transplanted hypothalamic neurons restore leptin signaling and ameliorate obesity in db/db mice. Science. 2011;334:1133-7 PMID 22116886 CrossRef
  283. Gold E, Jetly N, O'Bryan M, Meachem S, Srinivasan D, Behuria S, et al. Activin C antagonizes activin A in vitro and overexpression leads to pathologies in vivo. Am J Pathol. 2009;174:184-95 PMID 19095948 CrossRef
  284. Solier S, Sordet O, Kohn K, Pommier Y. Death receptor-induced activation of the Chk2- and histone H2AX-associated DNA damage response pathways. Mol Cell Biol. 2009;29:68-82 PMID 18955500 CrossRef
  285. Yuksek K, Chen W, Chien D, Ou J. Ubiquitin-independent degradation of hepatitis C virus F protein. J Virol. 2009;83:612-21 PMID 18971267 CrossRef
  286. Sõber S, Laan M, Annilo T. MicroRNAs miR-124 and miR-135a are potential regulators of the mineralocorticoid receptor gene (NR3C2) expression. Biochem Biophys Res Commun. 2010;391:727-32 PMID 19944075 CrossRef
  287. Magnus C, Lee P, Atasoy D, Su H, Looger L, Sternson S. Chemical and genetic engineering of selective ion channel-ligand interactions. Science. 2011;333:1292-6 PMID 21885782 CrossRef
  288. Saito D, Takase Y, Murai H, Takahashi Y. The dorsal aorta initiates a molecular cascade that instructs sympatho-adrenal specification. Science. 2012;336:1578-81 PMID 22723422 CrossRef
  289. Cruciat C, Ohkawara B, Acebron S, Karaulanov E, Reinhard C, Ingelfinger D, et al. Requirement of prorenin receptor and vacuolar H+-ATPase-mediated acidification for Wnt signaling. Science. 2010;327:459-63 PMID 20093472 CrossRef
  290. Utsunomiya H, Cheng Y, Lin Z, Reierstad S, Yin P, Attar E, et al. Upstream stimulatory factor-2 regulates steroidogenic factor-1 expression in endometriosis. Mol Endocrinol. 2008;22:904-14 PMID 18165439 CrossRef
  291. Lee H, Zhu X, Casadesus G, Pallas M, Camins A, O'NEILL M, et al. The effect of mGluR2 activation on signal transduction pathways and neuronal cell survival. Brain Res. 2009;1249:244-50 PMID 19026996 CrossRef
  292. Schnizler M, Schnizler K, Zha X, Hall D, Wemmie J, Hell J, et al. The cytoskeletal protein alpha-actinin regulates acid-sensing ion channel 1a through a C-terminal interaction. J Biol Chem. 2009;284:2697-705 PMID 19028690 CrossRef
  293. Dieterich D, Karpova A, Mikhaylova M, Zdobnova I, König I, Landwehr M, et al. Caldendrin-Jacob: a protein liaison that couples NMDA receptor signalling to the nucleus. PLoS Biol. 2008;6:e34 PMID 18303947 CrossRef
  294. Tomishige N, Kumagai K, Kusuda J, Nishijima M, Hanada K. Casein kinase I{gamma}2 down-regulates trafficking of ceramide in the synthesis of sphingomyelin. Mol Biol Cell. 2009;20:348-57 PMID 19005213 CrossRef
  295. Sunwoo H, Dinger M, Wilusz J, Amaral P, Mattick J, Spector D. MEN epsilon/beta nuclear-retained non-coding RNAs are up-regulated upon muscle differentiation and are essential components of paraspeckles. Genome Res. 2009;19:347-59 PMID 19106332 CrossRef
  296. Chae Y, Kang S, Kim M, Woo J, Lee J, Chang S, et al. Human AQP5 plays a role in the progression of chronic myelogenous leukemia (CML). PLoS ONE. 2008;3:e2594 PMID 18612408 CrossRef
  297. Baumforth K, Birgersdotter A, Reynolds G, Wei W, Kapatai G, Flavell J, et al. Expression of the Epstein-Barr virus-encoded Epstein-Barr virus nuclear antigen 1 in Hodgkin's lymphoma cells mediates Up-regulation of CCL20 and the migration of regulatory T cells. Am J Pathol. 2008;173:195-204 PMID 18502823 CrossRef
  298. Friedman J, Lackner L, West M, DiBenedetto J, Nunnari J, Voeltz G. ER tubules mark sites of mitochondrial division. Science. 2011;334:358-62 PMID 21885730 CrossRef
  299. Roger T, Froidevaux C, Le Roy D, Reymond M, Chanson A, Mauri D, et al. Protection from lethal gram-negative bacterial sepsis by targeting Toll-like receptor 4. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:2348-52 PMID 19181857 CrossRef
  300. Oldenburg M, Krüger A, Ferstl R, Kaufmann A, Nees G, Sigmund A, et al. TLR13 recognizes bacterial 23S rRNA devoid of erythromycin resistance-forming modification. Science. 2012;337:1111-5 PMID 22821982 CrossRef
  301. Simon D, Vadakkadath Meethal S, Wilson A, Gallego M, Weinecke S, Bruce E, et al. Activin receptor signaling regulates prostatic epithelial cell adhesion and viability. Neoplasia. 2009;11:365-76 PMID 19308291
  302. Shen Y, Tenney A, Busch S, Horn K, Cuascut F, Liu K, et al. PTPsigma is a receptor for chondroitin sulfate proteoglycan, an inhibitor of neural regeneration. Science. 2009;326:592-6 PMID 19833921 CrossRef
  303. Beck H, Semisch M, Culmsee C, Plesnila N, Hatzopoulos A. Egr-1 regulates expression of the glial scar component phosphacan in astrocytes after experimental stroke. Am J Pathol. 2008;173:77-92 PMID 18556777 CrossRef
  304. Ní Chonghaile T, Sarosiek K, Vo T, Ryan J, Tammareddi A, Moore V, et al. Pretreatment mitochondrial priming correlates with clinical response to cytotoxic chemotherapy. Science. 2011;334:1129-33 PMID 22033517 CrossRef
  305. Lee B, Moon J, Shu J, Yuan L, Newman Z, Schekman R, et al. UNC93B1 mediates differential trafficking of endosomal TLRs. elife. 2013;2:e00291 PMID 23426999 CrossRef
  306. Fine B, Hodakoski C, Koujak S, Su T, Saal L, Maurer M, et al. Activation of the PI3K pathway in cancer through inhibition of PTEN by exchange factor P-REX2a. Science. 2009;325:1261-5 PMID 19729658 CrossRef
  307. Butler T, Smith K, Self R, Braden B, Prendergast M. Sex differences in the neurotoxic effects of adenosine A1 receptor antagonism during ethanol withdrawal: reversal with an A1 receptor agonist or an NMDA receptor antagonist. Alcohol Clin Exp Res. 2008;32:1260-70 PMID 18482156 CrossRef
  308. Fogg D, Sibon C, Miled C, Jung S, Aucouturier P, Littman D, et al. A clonogenic bone marrow progenitor specific for macrophages and dendritic cells. Science. 2006;311:83-7 PMID 16322423
  309. Nishitsuji K, Tomiyama T, Ishibashi K, Ito K, Teraoka R, Lambert M, et al. The E693Delta mutation in amyloid precursor protein increases intracellular accumulation of amyloid beta oligomers and causes endoplasmic reticulum stress-induced apoptosis in cultured cells. Am J Pathol. 2009;174:957-69 PMID 19164507 CrossRef
  310. Yu L, Saile K, Swartz C, He H, Zheng X, Kissling G, et al. Differential expression of receptor tyrosine kinases (RTKs) and IGF-I pathway activation in human uterine leiomyomas. Mol Med. 2008;14:264-75 PMID 18231572 CrossRef
  311. Riquelme C, Magida J, Harrison B, Wall C, Marr T, Secor S, et al. Fatty acids identified in the Burmese python promote beneficial cardiac growth. Science. 2011;334:528-31 PMID 22034436 CrossRef
  312. Sathish N, Zhu F, Yuan Y. Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus ORF45 interacts with kinesin-2 transporting viral capsid-tegument complexes along microtubules. PLoS Pathog. 2009;5:e1000332 PMID 19282970 CrossRef
  313. Alerte T, Akinfolarin A, Friedrich E, Mader S, Hong C, Perez R. Alpha-synuclein aggregation alters tyrosine hydroxylase phosphorylation and immunoreactivity: lessons from viral transduction of knockout mice. Neurosci Lett. 2008;435:24-9 PMID 18314273 CrossRef
  314. Zella L, Shevde N, Hollis B, Cooke N, Pike J. Vitamin D-binding protein influences total circulating levels of 1,25-dihydroxyvitamin D3 but does not directly modulate the bioactive levels of the hormone in vivo. Endocrinology. 2008;149:3656-67 PMID 18372326 CrossRef
  315. Dressel R, Schindehütte J, Kuhlmann T, Elsner L, Novota P, Baier P, et al. The tumorigenicity of mouse embryonic stem cells and in vitro differentiated neuronal cells is controlled by the recipients' immune response. PLoS ONE. 2008;3:e2622 PMID 18612432 CrossRef
  316. Freed W, Chen J, Bäckman C, Schwartz C, Vazin T, Cai J, et al. Gene expression profile of neuronal progenitor cells derived from hESCs: activation of chromosome 11p15.5 and comparison to human dopaminergic neurons. PLoS ONE. 2008;3:e1422 PMID 18183302 CrossRef
  317. Yeruva S, Ramadori G, Raddatz D. NF-kappaB-dependent synergistic regulation of CXCL10 gene expression by IL-1beta and IFN-gamma in human intestinal epithelial cell lines. Int J Colorectal Dis. 2008;23:305-17 PMID 18046562
  318. Gottipati S, Cammarata P. Mitochondrial superoxide dismutase activation with 17 beta-estradiol-treated human lens epithelial cells. Mol Vis. 2008;14:898-905 PMID 18490963
  319. Ma G, Miettinen S, Porola P, Hedman K, Salo J, Konttinen Y. Human parainfluenza virus type 2 (HPIV2) induced host ADAM8 expression in human salivary adenocarcinoma cell line (HSY) during cell fusion. BMC Microbiol. 2009;9:55 PMID 19284887 CrossRef
  320. Menacho-Marquez M, García-Escudero R, Ojeda V, Abad A, Delgado P, Costa C, et al. The Rho exchange factors Vav2 and Vav3 favor skin tumor initiation and promotion by engaging extracellular signaling loops. PLoS Biol. 2013;11:e1001615 PMID 23935450 CrossRef
  321. Che X, Reichelt M, Sommer M, Rajamani J, Zerboni L, Arvin A. Functions of the ORF9-to-ORF12 gene cluster in varicella-zoster virus replication and in the pathogenesis of skin infection. J Virol. 2008;82:5825-34 PMID 18400847 CrossRef
  322. Suvorova E, Gripentrog J, Oppermann M, Miettinen H. Role of the carboxyl terminal di-leucine in phosphorylation and internalization of C5a receptor. Biochim Biophys Acta. 2008;1783:1261-70 PMID 18346468 CrossRef
  323. Hammar P, Leroy P, Mahmutovic A, Marklund E, Berg O, Elf J. The lac repressor displays facilitated diffusion in living cells. Science. 2012;336:1595-8 PMID 22723426 CrossRef
  324. Chang E, Charn T, Park S, Helferich W, Komm B, Katzenellenbogen J, et al. Estrogen Receptors alpha and beta as determinants of gene expression: influence of ligand, dose, and chromatin binding. Mol Endocrinol. 2008;22:1032-43 PMID 18258689 CrossRef
  325. Round J, Lee S, Li J, Tran G, Jabri B, Chatila T, et al. The Toll-like receptor 2 pathway establishes colonization by a commensal of the human microbiota. Science. 2011;332:974-7 PMID 21512004 CrossRef
  326. Zhao Y, Takeyama K, Sawatsubashi S, Ito S, Suzuki E, Yamagata K, et al. Corepressive action of CBP on androgen receptor transactivation in pericentric heterochromatin in a Drosophila experimental model system. Mol Cell Biol. 2009;29:1017-34 PMID 19075001 CrossRef
  327. Nold-Petry C, Nold M, Zepp J, Kim S, Voelkel N, Dinarello C. IL-32-dependent effects of IL-1beta on endothelial cell functions. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:3883-8 PMID 19228941 CrossRef
  328. McCartney S, Thackray L, Gitlin L, Gilfillan S, Virgin H, Virgin Iv H, et al. MDA-5 recognition of a murine norovirus. PLoS Pathog. 2008;4:e1000108 PMID 18636103 CrossRef
  329. Tran T, Temkin V, Shi B, Pagliari L, Daniel S, Ferran C, et al. TNFalpha-induced macrophage death via caspase-dependent and independent pathways. Apoptosis. 2009;14:320-32 PMID 19152111 CrossRef
  330. Guo X, Zhang G, Wang J, Liu W, Wang F, Dong J, et al. Prognostic relevance of Centromere protein H expression in esophageal carcinoma. BMC Cancer. 2008;8:233 PMID 18700042 CrossRef
  331. Le Clorennec C, Ouk T, Youlyouz-Marfak I, Panteix S, Martin C, Rastelli J, et al. Molecular basis of cytotoxicity of Epstein-Barr virus (EBV) latent membrane protein 1 (LMP1) in EBV latency III B cells: LMP1 induces type II ligand-independent autoactivation of CD95/Fas with caspase 8-mediated apoptosis. J Virol. 2008;82:6721-33 PMID 18448526 CrossRef
  332. Schneider D, Manzan M, Crawford R, Chen W, Kaminski N. 2,3,7,8-Tetrachlorodibenzo-p-dioxin-mediated impairment of B cell differentiation involves dysregulation of paired box 5 (Pax5) isoform, Pax5a. J Pharmacol Exp Ther. 2008;326:463-74 PMID 18483191 CrossRef
  333. Campos-Toimil M, Keravis T, Orallo F, Takeda K, Lugnier C. Short-term or long-term treatments with a phosphodiesterase-4 (PDE4) inhibitor result in opposing agonist-induced Ca(2+) responses in endothelial cells. Br J Pharmacol. 2008;154:82-92 PMID 18311187 CrossRef
  334. Kim T, Oh S, Kim Y, Lee M, Kim H, Myung S. Granulocyte macrophage colony-stimulating factor may modulate the post-transcription pathway of interleukin-6 expression in prostate carcinoma cells. J Korean Med Sci. 2008;23:94-7 PMID 18303206 CrossRef
  335. Martín-Vílchez S, Molina-Jiménez F, Alonso-Lebrero J, Sanz-Cameno P, Rodríguez-Muñoz Y, Benedicto I, et al. AM3, a natural glycoconjugate, induces the functional maturation of human dendritic cells. Br J Pharmacol. 2008;154:698-708 PMID 18414382 CrossRef
  336. Arenas F, Hervias I, Uriz M, Joplin R, Prieto J, Medina J. Combination of ursodeoxycholic acid and glucocorticoids upregulates the AE2 alternate promoter in human liver cells. J Clin Invest. 2008;118:695-709 PMID 18188457 CrossRef
  337. Capitini C, Herby S, Milliron M, Anver M, Mackall C, Fry T. Bone marrow deficient in IFN-{gamma} signaling selectively reverses GVHD-associated immunosuppression and enhances a tumor-specific GVT effect. Blood. 2009;113:5002-9 PMID 19258593 CrossRef
  338. Cardoso C, Groth-Pedersen L, Høyer-Hansen M, Kirkegaard T, Corcelle E, Andersen J, et al. Depletion of kinesin 5B affects lysosomal distribution and stability and induces peri-nuclear accumulation of autophagosomes in cancer cells. PLoS ONE. 2009;4:e4424 PMID 19242560 CrossRef
  339. Olszak T, An D, Zeissig S, Vera M, Richter J, Franke A, et al. Microbial exposure during early life has persistent effects on natural killer T cell function. Science. 2012;336:489-93 PMID 22442383 CrossRef
  340. Hyman M, Petrovic-Djergovic D, Visovatti S, Liao H, Yanamadala S, Bouïs D, et al. Self-regulation of inflammatory cell trafficking in mice by the leukocyte surface apyrase CD39. J Clin Invest. 2009;119:1136-49 PMID 19381014 CrossRef
  341. Rosengren A, Jokubka R, Tojjar D, Granhall C, Hansson O, Li D, et al. Overexpression of alpha2A-adrenergic receptors contributes to type 2 diabetes. Science. 2010;327:217-20 PMID 19965390 CrossRef
  342. Yavelsky V, Rohkin S, Shaco-Levy R, Tzikinovsky A, Amir T, Kohn H, et al. Native human autoantibodies targeting GIPC1 identify differential expression in malignant tumors of the breast and ovary. BMC Cancer. 2008;8:247 PMID 18721484 CrossRef
  343. Kron K, Pethe V, Briollais L, Sadikovic B, Ozcelik H, Sunderji A, et al. Discovery of novel hypermethylated genes in prostate cancer using genomic CpG island microarrays. PLoS ONE. 2009;4:e4830 PMID 19283074 CrossRef
  344. Thaunat O, Granja A, Barral P, Filby A, Montaner B, Collinson L, et al. Asymmetric segregation of polarized antigen on B cell division shapes presentation capacity. Science. 2012;335:475-9 PMID 22282815 CrossRef
  345. Wu W, Alexis N, Chen X, Bromberg P, Peden D. Involvement of mitogen-activated protein kinases and NFkappaB in LPS-induced CD40 expression on human monocytic cells. Toxicol Appl Pharmacol. 2008;228:135-43 PMID 18187173 CrossRef
  346. Lam W, Tang J, Yeung A, Chiu L, Sung J, Chan P. Avian influenza virus A/HK/483/97(H5N1) NS1 protein induces apoptosis in human airway epithelial cells. J Virol. 2008;82:2741-51 PMID 18199656 CrossRef
  347. Zhang Y, Liu T, Yan P, Huang T, DeWille J. Identification and characterization of CCAAT/Enhancer Binding proteindelta (C/EBPdelta) target genes in G0 growth arrested mammary epithelial cells. BMC Mol Biol. 2008;9:83 PMID 18828910 CrossRef
  348. Lu Q, Zhang J, Allison R, Gay H, Yang W, Bhowmick N, et al. Identification of extracellular delta-catenin accumulation for prostate cancer detection. Prostate. 2009;69:411-8 PMID 19116988 CrossRef
  349. Voth D, Heinzen R. Sustained activation of Akt and Erk1/2 is required for Coxiella burnetii antiapoptotic activity. Infect Immun. 2009;77:205-13 PMID 18981248 CrossRef
  350. Jin D, Ojcius D, Sun D, Dong H, Luo Y, Mao Y, et al. Leptospira interrogans induces apoptosis in macrophages via caspase-8- and caspase-3-dependent pathways. Infect Immun. 2009;77:799-809 PMID 19029301 CrossRef
  351. Issar N, Roux E, Mattei D, Scherf A. Identification of a novel post-translational modification in Plasmodium falciparum: protein sumoylation in different cellular compartments. Cell Microbiol. 2008;10:1999-2011 PMID 18547337 CrossRef
  352. Li Y, Maedler K, Shu L, Haataja L. UCP-2 and UCP-3 proteins are differentially regulated in pancreatic beta-cells. PLoS ONE. 2008;3:e1397 PMID 18167556 CrossRef
  353. Perfettini J, Nardacci R, Bourouba M, Subra F, Gros L, Séror C, et al. Critical involvement of the ATM-dependent DNA damage response in the apoptotic demise of HIV-1-elicited syncytia. PLoS ONE. 2008;3:e2458 PMID 18560558 CrossRef
  354. Longo N, Lugar P, Yavuz S, Zhang W, Krijger P, Russ D, et al. Analysis of somatic hypermutation in X-linked hyper-IgM syndrome shows specific deficiencies in mutational targeting. Blood. 2009;113:3706-15 PMID 19023113 CrossRef
  355. Yap O, Bhat G, Liu L, Tollefsbol T. Epigenetic modifications of the Estrogen receptor beta gene in epithelial ovarian cancer cells. Anticancer Res. 2009;29:139-44 PMID 19331143
  356. Tan Y, Abad C, Lopez R, Dong H, Liu S, Lee A, et al. Pituitary adenylyl cyclase-activating polypeptide is an intrinsic regulator of Treg abundance and protects against experimental autoimmune encephalomyelitis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:2012-7 PMID 19190179 CrossRef
  357. Yang H, Shen L, Siliciano R, Pomerantz J. Isolation of a cellular factor that can reactivate latent HIV-1 without T cell activation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:6321-6 PMID 19336585 CrossRef
  358. Sprynski A, Hose D, Caillot L, Reme T, Shaughnessy J, Barlogie B, et al. The role of IGF-1 as a major growth factor for myeloma cell lines and the prognostic relevance of the expression of its receptor. Blood. 2009;113:4614-26 PMID 19228610 CrossRef
  359. Dianzani C, Brucato L, Gallicchio M, Rosa A, Collino M, Fantozzi R. Celecoxib modulates adhesion of HT29 colon cancer cells to vascular endothelial cells by inhibiting ICAM-1 and VCAM-1 expression. Br J Pharmacol. 2008;153:1153-61 PMID 18084316
  360. Wu W, Sung J, Wu Y, Li Z, Yu L, Cho C. Bone morphogenetic protein signalling is required for the anti-mitogenic effect of the proteasome inhibitor MG-132 on colon cancer cells. Br J Pharmacol. 2008;154:632-8 PMID 18414391 CrossRef
  361. Fan H, Zhao Z, Cheng J, Su X, Wu Q, Shan Y. Overexpression of DNA methyltransferase 1 and its biological significance in primary hepatocellular carcinoma. World J Gastroenterol. 2009;15:2020-6 PMID 19399937
  362. Jain M, Nilsson R, Sharma S, Madhusudhan N, Kitami T, Souza A, et al. Metabolite profiling identifies a key role for glycine in rapid cancer cell proliferation. Science. 2012;336:1040-4 PMID 22628656 CrossRef
  363. Schuller H, Al-Wadei H, Majidi M. Gamma-aminobutyric acid, a potential tumor suppressor for small airway-derived lung adenocarcinoma. Carcinogenesis. 2008;29:1979-85 PMID 18310090 CrossRef
  364. Wang W, Zhao X, Wang H, Liang Y. Increased fatty acid synthase as a potential therapeutic target in multiple myeloma. J Zhejiang Univ Sci B. 2008;9:441-7 PMID 18543396 CrossRef
  365. Xie Z, Wroblewska L, Prochazka L, Weiss R, Benenson Y. Multi-input RNAi-based logic circuit for identification of specific cancer cells. Science. 2011;333:1307-11 PMID 21885784 CrossRef
  366. Djoba Siawaya J, Roberts T, Babb C, Black G, Golakai H, Stanley K, et al. An evaluation of commercial fluorescent bead-based luminex cytokine assays. PLoS ONE. 2008;3:e2535 PMID 18596971 CrossRef
  367. Adrain C, Zettl M, Christova Y, Taylor N, Freeman M. Tumor necrosis factor signaling requires iRhom2 to promote trafficking and activation of TACE. Science. 2012;335:225-8 PMID 22246777 CrossRef
  368. Bogunovic D, Byun M, Durfee L, Abhyankar A, Sanal O, Mansouri D, et al. Mycobacterial disease and impaired IFN-γ immunity in humans with inherited ISG15 deficiency. Science. 2012;337:1684-8 PMID 22859821
  369. Stros M, Polanská E, Struncová S, Pospisilova S. HMGB1 and HMGB2 proteins up-regulate cellular expression of human topoisomerase IIalpha. Nucleic Acids Res. 2009;37:2070-86 PMID 19223331 CrossRef
  370. Godinez I, Raffatellu M, Chu H, Paixao T, Haneda T, Santos R, et al. Interleukin-23 orchestrates mucosal responses to Salmonella enterica serotype Typhimurium in the intestine. Infect Immun. 2009;77:387-98 PMID 18955477 CrossRef
  371. Amoruso A, Bardelli C, Gunella G, Ribichini F, Brunelleschi S. A novel activity for substance P: stimulation of peroxisome proliferator-activated receptor-gamma protein expression in human monocytes and macrophages. Br J Pharmacol. 2008;154:144-52 PMID 18278062 CrossRef
  372. Janic B, Iskander A, Rad A, Soltanian-Zadeh H, Arbab A. Effects of ferumoxides-protamine sulfate labeling on immunomodulatory characteristics of macrophage-like THP-1 cells. PLoS ONE. 2008;3:e2499 PMID 18575575 CrossRef
  373. Bonneh-Barkay D, Bissel S, Wang G, Fish K, Nicholl G, Darko S, et al. YKL-40, a marker of simian immunodeficiency virus encephalitis, modulates the biological activity of basic fibroblast growth factor. Am J Pathol. 2008;173:130-43 PMID 18556781 CrossRef
  374. Khandrika L, Lieberman R, Koul S, Kumar B, Maroni P, Chandhoke R, et al. Hypoxia-associated p38 mitogen-activated protein kinase-mediated androgen receptor activation and increased HIF-1alpha levels contribute to emergence of an aggressive phenotype in prostate cancer. Oncogene. 2009;28:1248-60 PMID 19151763 CrossRef
  375. Yang J, Zhao T, Goldstein J, Brown M. Inhibition of ghrelin O-acyltransferase (GOAT) by octanoylated pentapeptides. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:10750-5 PMID 18669668 CrossRef
  376. Kowalski M, Wolska A, Grzegorczyk J, Hilt J, Jarzebska M, Drobniewski M, et al. Increased responsiveness to toll-like receptor 4 stimulation in peripheral blood mononuclear cells from patients with recent onset rheumatoid arthritis. Mediators Inflamm. 2008;2008:132732 PMID 18584044 CrossRef
  377. Petersen A, Carlsson T, Karlsson J, Jonhede S, Zetterberg M. Effects of dexamethasone on human lens epithelial cells in culture. Mol Vis. 2008;14:1344-52 PMID 18648526
  378. Kirino Y, Takeno M, Watanabe R, Murakami S, Kobayashi M, Ideguchi H, et al. Association of reduced heme oxygenase-1 with excessive Toll-like receptor 4 expression in peripheral blood mononuclear cells in Behçet's disease. Arthritis Res Ther. 2008;10:R16 PMID 18234118 CrossRef
  379. Schiller H, Szekeres A, Binder B, Stockinger H, Leksa V. Mannose 6-phosphate/insulin-like growth factor 2 receptor limits cell invasion by controlling alphaVbeta3 integrin expression and proteolytic processing of urokinase-type plasminogen activator receptor. Mol Biol Cell. 2009;20:745-56 PMID 19037107 CrossRef
  380. Huang Y, Bao Y, Peng W, Goldberg M, Love K, Bumcrot D, et al. Claudin-3 gene silencing with siRNA suppresses ovarian tumor growth and metastasis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:3426-30 PMID 19208807 CrossRef
  381. Esteban V, Heringer-Walther S, Sterner-Kock A, de Bruin R, van den Engel S, Wang Y, et al. Angiotensin-(1-7) and the g protein-coupled receptor MAS are key players in renal inflammation. PLoS ONE. 2009;4:e5406 PMID 19404405 CrossRef
  382. Kuerten S, Schlingmann T, Rajasalu T, Angelov D, Lehmann P, Tary-Lehmann M. Lack of disease specificity limits the usefulness of in vitro costimulation in HIV- and HCV-infected patients. Clin Dev Immunol. 2008;2008:590941 PMID 18670652 CrossRef
  383. Slipicevic A, Jørgensen K, Skrede M, Rosnes A, Trøen G, Davidson B, et al. The fatty acid binding protein 7 (FABP7) is involved in proliferation and invasion of melanoma cells. BMC Cancer. 2008;8:276 PMID 18826602 CrossRef
  384. Burdak-Rothkamm S, Rothkamm K, Prise K. ATM acts downstream of ATR in the DNA damage response signaling of bystander cells. Cancer Res. 2008;68:7059-65 PMID 18757420 CrossRef
  385. Chan C, Wong N, Liu Y, Bicknell D, Turley H, Hollins L, et al. Gastrointestinal differentiation marker Cytokeratin 20 is regulated by homeobox gene CDX1. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:1936-41 PMID 19188603 CrossRef
  386. Vaishnava S, Yamamoto M, Severson K, Ruhn K, Yu X, Koren O, et al. The antibacterial lectin RegIIIgamma promotes the spatial segregation of microbiota and host in the intestine. Science. 2011;334:255-8 PMID 21998396 CrossRef
  387. Kwon H, Oh S, Kim J. Glabridin, a functional compound of liquorice, attenuates colonic inflammation in mice with dextran sulphate sodium-induced colitis. Clin Exp Immunol. 2008;151:165-73 PMID 18005263
  388. Peng T, Chen J, Mao W, Liu X, Tao Y, Chen L, et al. Potential therapeutic significance of increased expression of aryl hydrocarbon receptor in human gastric cancer. World J Gastroenterol. 2009;15:1719-29 PMID 19360915
  389. Colombatti M, Grasso S, Porzia A, Fracasso G, Scupoli M, Cingarlini S, et al. The prostate specific membrane antigen regulates the expression of IL-6 and CCL5 in prostate tumour cells by activating the MAPK pathways. PLoS ONE. 2009;4:e4608 PMID 19242540 CrossRef
  390. Chen Y, Hsu H, Chen Y, Tsai T, How C, Wang C, et al. Oct-4 expression maintained cancer stem-like properties in lung cancer-derived CD133-positive cells. PLoS ONE. 2008;3:e2637 PMID 18612434 CrossRef
  391. Sigulinsky C, Green E, Clark A, Levine E. Vsx2/Chx10 ensures the correct timing and magnitude of Hedgehog signaling in the mouse retina. Dev Biol. 2008;317:560-75 PMID 18417110 CrossRef
  392. Shin Y, Kim M, Oh J, Wee W, Lee J, Ko J, et al. Short-term Efficacy of Topical Immunosuppressive Agents on the Survival of Cultivated Allo-Conjunctival Equivalents. Korean J Ophthalmol. 2008;22:123-9 PMID 18612231 CrossRef
  393. Simeone A, McMurtry V, Nieves-Alicea R, Saavedra J, Keefer L, Johnson M, et al. TIMP-2 mediates the anti-invasive effects of the nitric oxide-releasing prodrug JS-K in breast cancer cells. Breast Cancer Res. 2008;10:R44 PMID 18474097 CrossRef
  394. Schroering A, Williams K. Rapid induction of chromatin-associated DNA mismatch repair proteins after MNNG treatment. DNA Repair (Amst). 2008;7:951-69 PMID 18468964 CrossRef
  395. Korhonen H, Fisslthaler B, Moers A, Wirth A, Habermehl D, Wieland T, et al. Anaphylactic shock depends on endothelial Gq/G11. J Exp Med. 2009;206:411-20 PMID 19171764 CrossRef
  396. Maître J, Berthoumieux H, Krens S, Salbreux G, Jülicher F, Paluch E, et al. Adhesion functions in cell sorting by mechanically coupling the cortices of adhering cells. Science. 2012;338:253-6 PMID 22923438 CrossRef
  397. Maluykova I, Gutsal O, Laiko M, Kane A, Donowitz M, Kovbasnjuk O. Latrunculin B facilitates Shiga toxin 1 transcellular transcytosis across T84 intestinal epithelial cells. Biochim Biophys Acta. 2008;1782:370-7 PMID 18342638 CrossRef
  398. Dylla D, Michele D, Campbell K, McCray P. Basolateral entry and release of New and Old World arenaviruses from human airway epithelia. J Virol. 2008;82:6034-8 PMID 18417570 CrossRef
  399. Reber L, Vermeulen L, Haegeman G, Frossard N. Ser276 phosphorylation of NF-kB p65 by MSK1 controls SCF expression in inflammation. PLoS ONE. 2009;4:e4393 PMID 19197368 CrossRef
  400. Liu D, Jin L, Wang H, Zhao H, Zhao C, Duan C, et al. Silencing alpha-synuclein gene expression enhances tyrosine hydroxylase activity in MN9D cells. Neurochem Res. 2008;33:1401-9 PMID 18357527 CrossRef
  401. Zhang S, Balch C, Chan M, Lai H, Matei D, Schilder J, et al. Identification and characterization of ovarian cancer-initiating cells from primary human tumors. Cancer Res. 2008;68:4311-20 PMID 18519691 CrossRef
  402. Bernardino A, Myers T, Alvarez X, Hasegawa A, Philipp M. Toll-like receptors: insights into their possible role in the pathogenesis of lyme neuroborreliosis. Infect Immun. 2008;76:4385-95 PMID 18694963 CrossRef
  403. Tan Y, Zhang B, Wu T, Skogerbø G, Zhu X, Guo X, et al. Transcriptional inhibiton of Hoxd4 expression by miRNA-10a in human breast cancer cells. BMC Mol Biol. 2009;10:12 PMID 19232136 CrossRef
  404. Lechner S, Frenzel H, Wang R, Lewin G. Developmental waves of mechanosensitivity acquisition in sensory neuron subtypes during embryonic development. EMBO J. 2009;28:1479-91 PMID 19322198 CrossRef
  405. Brohawn S, del Mármol J, MacKinnon R. Crystal structure of the human K2P TRAAK, a lipid- and mechano-sensitive K+ ion channel. Science. 2012;335:436-41 PMID 22282805 CrossRef
  406. Brough D, Pelegrin P, Rothwell N. Pannexin-1-dependent caspase-1 activation and secretion of IL-1beta is regulated by zinc. Eur J Immunol. 2009;39:352-8 PMID 19130485 CrossRef
  407. Garbarini N, Delpire E. The RCC1 domain of protein associated with Myc (PAM) interacts with and regulates KCC2. Cell Physiol Biochem. 2008;22:31-44 PMID 18769030 CrossRef
  408. Martínez-Sanz E, Del Río A, Barrio C, Murillo J, Maldonado E, Garcillán B, et al. Alteration of medial-edge epithelium cell adhesion in two Tgf-beta3 null mouse strains. Differentiation. 2008;76:417-30 PMID 18431835
  409. Lei P, Abdelrahim M, Cho S, Liu S, Chintharlapalli S, Safe S. 1,1-Bis(3'-indolyl)-1-(p-substituted phenyl)methanes inhibit colon cancer cell and tumor growth through activation of c-jun N-terminal kinase. Carcinogenesis. 2008;29:1139-47 PMID 18460448 CrossRef
  410. Hockings J, Degner S, Morgan S, Kemp M, Romagnolo D. Involvement of a specificity proteins-binding element in regulation of basal and estrogen-induced transcription activity of the BRCA1 gene. Breast Cancer Res. 2008;10:R29 PMID 18377656 CrossRef
  411. Harduf H, Goldman S, Shalev E. Progesterone receptor A and c-Met mediates spheroids-endometrium attachment. Reprod Biol Endocrinol. 2009;7:14 PMID 19220894 CrossRef
  412. Mense S, Chhabra J, Bhat H. Preferential induction of cytochrome P450 1A1 over cytochrome P450 1B1 in human breast epithelial cells following exposure to quercetin. J Steroid Biochem Mol Biol. 2008;110:157-62 PMID 18456490 CrossRef
  413. Makarem M, Kannan N, Nguyen L, Knapp D, Balani S, Prater M, et al. Developmental changes in the in vitro activated regenerative activity of primitive mammary epithelial cells. PLoS Biol. 2013;11:e1001630 PMID 23966837 CrossRef
  414. Stoikos C, Harrison C, Salamonsen L, Dimitriadis E. A distinct cohort of the TGFbeta superfamily members expressed in human endometrium regulate decidualization. Hum Reprod. 2008;23:1447-56 PMID 18434375 CrossRef
  415. Sengupta P, Philip F, Scarlata S. Caveolin-1 alters Ca(2+) signal duration through specific interaction with the G alpha q family of G proteins. J Cell Sci. 2008;121:1363-72 PMID 18397999 CrossRef
  416. Sato Y, Iketani M, Kurihara Y, Yamaguchi M, Yamashita N, Nakamura F, et al. Cartilage acidic protein-1B (LOTUS), an endogenous Nogo receptor antagonist for axon tract formation. Science. 2011;333:769-73 PMID 21817055 CrossRef
  417. Werner S, Dotzlaf J, Smith R. MMP-28 as a regulator of myelination. BMC Neurosci. 2008;9:83 PMID 18778487 CrossRef
  418. Ramamoorthi K, Fropf R, Belfort G, Fitzmaurice H, McKinney R, Neve R, et al. Npas4 regulates a transcriptional program in CA3 required for contextual memory formation. Science. 2011;334:1669-75 PMID 22194569 CrossRef
  419. Liang M, Wendland J, Chuang D. Lithium inhibits Smad3/4 transactivation via increased CREB activity induced by enhanced PKA and AKT signaling. Mol Cell Neurosci. 2008;37:440-53 PMID 18077182
  420. Cambray S, Pedraza N, Rafel M, Garí E, Aldea M, Gallego C. Protein kinase KIS localizes to RNA granules and enhances local translation. Mol Cell Biol. 2009;29:726-35 PMID 19015237 CrossRef
  421. Ko H, Bailey R, Smith W, Liu Z, Shin J, Lee Y, et al. CHIP regulates leucine-rich repeat kinase-2 ubiquitination, degradation, and toxicity. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:2897-902 PMID 19196961 CrossRef
  422. Flora A, Klisch T, Schuster G, Zoghbi H. Deletion of Atoh1 disrupts Sonic Hedgehog signaling in the developing cerebellum and prevents medulloblastoma. Science. 2009;326:1424-7 PMID 19965762 CrossRef
  423. Treusch S, Hamamichi S, Goodman J, Matlack K, Chung C, Baru V, et al. Functional links between Aβ toxicity, endocytic trafficking, and Alzheimer's disease risk factors in yeast. Science. 2011;334:1241-5 PMID 22033521 CrossRef
  424. Singh D, Chan J, Zoppoli P, Niola F, Sullivan R, Castaño A, et al. Transforming fusions of FGFR and TACC genes in human glioblastoma. Science. 2012;337:1231-5 PMID 22837387 CrossRef
  425. Bosveld F, Bonnet I, Guirao B, Tlili S, Wang Z, Petitalot A, et al. Mechanical control of morphogenesis by Fat/Dachsous/Four-jointed planar cell polarity pathway. Science. 2012;336:724-7 PMID 22499807 CrossRef
  426. Deng H, Hughes S, Bell J, Simmonds A. Alternative requirements for Vestigial, Scalloped, and Dmef2 during muscle differentiation in Drosophila melanogaster. Mol Biol Cell. 2009;20:256-69 PMID 18987343 CrossRef
  427. Schultz K, Wetter J, Fiore D, Friesen P. Transactivator IE1 is required for baculovirus early replication events that trigger apoptosis in permissive and nonpermissive cells. J Virol. 2009;83:262-72 PMID 18945761 CrossRef
  428. Whitfield Z, Chisholm J, Hawley R, Orr-Weaver T. A Meiosis-Specific Form of the APC/C Promotes the Oocyte-to-Embryo Transition by Decreasing Levels of the Polo Kinase Inhibitor Matrimony. PLoS Biol. 2013;11:e1001648 PMID 24019759 CrossRef
  429. Colombani J, Andersen D, Leopold P. Secreted peptide Dilp8 coordinates Drosophila tissue growth with developmental timing. Science. 2012;336:582-5 PMID 22556251 CrossRef
  430. Wilson P, Fazzone W, LaBonte M, Lenz H, Ladner R. Regulation of human dUTPase gene expression and p53-mediated transcriptional repression in response to oxaliplatin-induced DNA damage. Nucleic Acids Res. 2009;37:78-95 PMID 19015155 CrossRef
  431. Su L, Zhai R, Sheu C, Gallagher D, Gong M, Tejera P, et al. Genetic variants in the angiopoietin-2 gene are associated with increased risk of ARDS. Intensive Care Med. 2009;35:1024-30 PMID 19271210 CrossRef
  432. Vos M, Esposito G, Edirisinghe J, Vilain S, Haddad D, Slabbaert J, et al. Vitamin K2 is a mitochondrial electron carrier that rescues pink1 deficiency. Science. 2012;336:1306-10 PMID 22582012 CrossRef
  433. Zhao T, Graham O, Raposo A, St Johnston D. Growing microtubules push the oocyte nucleus to polarize the Drosophila dorsal-ventral axis. Science. 2012;336:999-1003 PMID 22499806 CrossRef
  434. Janda C, Waghray D, Levin A, Thomas C, Garcia K. Structural basis of Wnt recognition by Frizzled. Science. 2012;337:59-64 PMID 22653731 CrossRef
  435. Mendiburo M, Padeken J, Fülöp S, Schepers A, Heun P. Drosophila CENH3 is sufficient for centromere formation. Science. 2011;334:686-90 PMID 22053052 CrossRef
  436. Gu H, Roizman B. The two functions of herpes simplex virus 1 ICP0, inhibition of silencing by the CoREST/REST/HDAC complex and degradation of PML, are executed in tandem. J Virol. 2009;83:181-7 PMID 18945770 CrossRef
  437. Lee I, Kawai Y, Fergusson M, Rovira I, Bishop A, Motoyama N, et al. Atg7 modulates p53 activity to regulate cell cycle and survival during metabolic stress. Science. 2012;336:225-8 PMID 22499945 CrossRef
  438. Login F, Balmand S, Vallier A, Vincent-Monegat C, Vigneron A, Weiss-Gayet M, et al. Antimicrobial peptides keep insect endosymbionts under control. Science. 2011;334:362-5 PMID 22021855 CrossRef
  439. Hoskins A, Friedman L, Gallagher S, Crawford D, Anderson E, Wombacher R, et al. Ordered and dynamic assembly of single spliceosomes. Science. 2011;331:1289-95 PMID 21393538 CrossRef
  440. Li Z, Yi Y, Yin X, Zhang Z, Liu J. Expression of foot-and-mouth disease virus capsid proteins in silkworm-baculovirus expression system and its utilization as a subunit vaccine. PLoS ONE. 2008;3:e2273 PMID 18509464 CrossRef
  441. Heisel S, Ketter R, Keller A, Klein V, Pallasch C, Lenhof H, et al. Increased seroreactivity to glioma-expressed antigen 2 in brain tumor patients under radiation. PLoS ONE. 2008;3:e2164 PMID 18478111 CrossRef
  442. Li B, Li D, Li G, Wang H, Yu A. P58(IPK) inhibition of endoplasmic reticulum stress in human retinal capillary endothelial cells in vitro. Mol Vis. 2008;14:1122-8 PMID 18568130
  443. Li B, Zhang H, Shi Y, Min Y, Lin S, Wu K, et al. Overexpression of nuclear transport factor 2 may protect against diabetic retinopathy. Mol Vis. 2009;15:861-9 PMID 19404486
  444. Mangan S, Clancy P, Golledge J. Modulation of endothelial cell thrombomodulin by PPAR ligands--variation according to environment. Thromb Res. 2008;121:827-34 PMID 17869327
  445. Choi Y, Nicholas J. Autocrine and paracrine promotion of cell survival and virus replication by human herpesvirus 8 chemokines. J Virol. 2008;82:6501-13 PMID 18434408 CrossRef
  446. Imaeda A, Watanabe A, Sohail M, Mahmood S, Mohamadnejad M, Sutterwala F, et al. Acetaminophen-induced hepatotoxicity in mice is dependent on Tlr9 and the Nalp3 inflammasome. J Clin Invest. 2009;119:305-14 PMID 19164858 CrossRef
  447. Julien S, Kreppel F, Beck S, Heiduschka P, Brito V, Schnichels S, et al. A reproducible and quantifiable model of choroidal neovascularization induced by VEGF A165 after subretinal adenoviral gene transfer in the rabbit. Mol Vis. 2008;14:1358-72 PMID 18682809
  448. Zhang L, Wu Y, Jia Z, Zhang Y, Shen H, Wang X. Protective effects of a compound herbal extract (Tong Xin Luo) on free fatty acid induced endothelial injury: implications of antioxidant system. BMC Complement Altern Med. 2008;8:39 PMID 18625049 CrossRef
  449. Castillo-Acosta V, Ruiz-Perez L, Yang W, Gonzalez-Pacanowska D, Vidal A. Identification of a residue critical for the excision of 3'-blocking ends in apurinic/apyrimidinic endonucleases of the Xth family. Nucleic Acids Res. 2009;37:1829-42 PMID 19181704 CrossRef
  450. Yi Z, Cho S, Zhao H, Wu Y, Luo J, Li D, et al. A novel peptide from human apolipoprotein(a) inhibits angiogenesis and tumor growth by targeting c-Src phosphorylation in VEGF-induced human umbilical endothelial cells. Int J Cancer. 2009;124:843-52 PMID 19035465 CrossRef
  451. Clarke C, Forman S, Pritchett J, Ohanian V, Ohanian J. Phospholipase C-delta1 modulates sustained contraction of rat mesenteric small arteries in response to noradrenaline, but not endothelin-1. Am J Physiol Heart Circ Physiol. 2008;295:H826-34 PMID 18567701 CrossRef
  452. Karanikas V, Speletas M, Zamanakou M, Kalala F, Loules G, Kerenidi T, et al. Foxp3 expression in human cancer cells. J Transl Med. 2008;6:19 PMID 18430198 CrossRef
  453. Strååt K, de Klark R, Gredmark-Russ S, Eriksson P, Soderberg-Naucler C. Infection with human cytomegalovirus alters the MMP-9/TIMP-1 balance in human macrophages. J Virol. 2009;83:830-5 PMID 18945772 CrossRef
  454. O'Hagan K, Cocchiglia S, Zhdanov A, Tambuwala M, Tambawala M, Cummins E, et al. PGC-1alpha is coupled to HIF-1alpha-dependent gene expression by increasing mitochondrial oxygen consumption in skeletal muscle cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:2188-93 PMID 19179292 CrossRef
  455. Sarrazin A, Peel A, Averof M. A segmentation clock with two-segment periodicity in insects. Science. 2012;336:338-41 PMID 22403177 CrossRef
  456. Dho S, Deverman B, Lapid C, Manson S, Gan L, Riehm J, et al. Control of Cellular Bcl-xL Levels by Deamidation-Regulated Degradation. PLoS Biol. 2013;11:e1001588 PMID 23823868 CrossRef
  457. Milovanova T, Bhopale V, Sorokina E, Moore J, Hunt T, Hauer-Jensen M, et al. Lactate stimulates vasculogenic stem cells via the thioredoxin system and engages an autocrine activation loop involving hypoxia-inducible factor 1. Mol Cell Biol. 2008;28:6248-61 PMID 18710947 CrossRef
  458. Ross E, Freeman S, Zhao Y, Dhanjal T, Ross E, Lax S, et al. A novel role for PECAM-1 (CD31) in regulating haematopoietic progenitor cell compartmentalization between the peripheral blood and bone marrow. PLoS ONE. 2008;3:e2338 PMID 18523558 CrossRef
  459. Levi B, Yilmaz O, Duester G, Morrison S. Aldehyde dehydrogenase 1a1 is dispensable for stem cell function in the mouse hematopoietic and nervous systems. Blood. 2009;113:1670-80 PMID 18971422 CrossRef
  460. He H, Wang Y, Guo X, Ramchandani S, Ma J, Shen M, et al. Pot1b deletion and telomerase haploinsufficiency in mice initiate an ATR-dependent DNA damage response and elicit phenotypes resembling dyskeratosis congenita. Mol Cell Biol. 2009;29:229-40 PMID 18936156 CrossRef
  461. Hensel Z, Weng X, Lagda A, Xiao J. Transcription-Factor-Mediated DNA Looping Probed by High-Resolution, Single-Molecule Imaging in Live E. coli Cells. PLoS Biol. 2013;11:e1001591 PMID 23853547 CrossRef
  462. Maddaluno L, Verbrugge S, Martinoli C, Matteoli G, Chiavelli A, Zeng Y, et al. The adhesion molecule L1 regulates transendothelial migration and trafficking of dendritic cells. J Exp Med. 2009;206:623-35 PMID 19273627 CrossRef
  463. Oganesian A, Armstrong L, Migliorini M, Strickland D, Bornstein P. Thrombospondins use the VLDL receptor and a nonapoptotic pathway to inhibit cell division in microvascular endothelial cells. Mol Biol Cell. 2008;19:563-71 PMID 18032585
  464. Homer H, Gui L, Carroll J. A spindle assembly checkpoint protein functions in prophase I arrest and prometaphase progression. Science. 2009;326:991-4 PMID 19965510 CrossRef
  465. Oh J, Susor A, Conti M. Protein tyrosine kinase Wee1B is essential for metaphase II exit in mouse oocytes. Science. 2011;332:462-5 PMID 21454751 CrossRef
  466. Gari K, León Ortiz A, Borel V, Flynn H, Skehel J, Boulton S. MMS19 links cytoplasmic iron-sulfur cluster assembly to DNA metabolism. Science. 2012;337:243-5 PMID 22678361 CrossRef
  467. Lu Z, Wang Z, Liu Y, Wu C, Wang C, Zhang B, et al. Association of estrogen receptor alpha gene polymorphisms with cytokine genes expression in systemic lupus erythematosus. Croat Med J. 2009;50:117-23 PMID 19399944
  468. Peacock J, Palmer J, Fink D, Ip S, Pietras E, Mui A, et al. PTEN loss promotes mitochondrially dependent type II Fas-induced apoptosis via PEA-15. Mol Cell Biol. 2009;29:1222-34 PMID 19103758 CrossRef
  469. Bright R, Carter D, Crevar C, Toapanta F, Steckbeck J, Cole K, et al. Cross-clade protective immune responses to influenza viruses with H5N1 HA and NA elicited by an influenza virus-like particle. PLoS ONE. 2008;3:e1501 PMID 18231588 CrossRef
  470. Corti D, Voss J, Gamblin S, Codoni G, Macagno A, Jarrossay D, et al. A neutralizing antibody selected from plasma cells that binds to group 1 and group 2 influenza A hemagglutinins. Science. 2011;333:850-6 PMID 21798894 CrossRef
  471. Schirle N, Macrae I. The crystal structure of human Argonaute2. Science. 2012;336:1037-40 PMID 22539551 CrossRef
  472. Garelli A, Gontijo A, Miguela V, Caparros E, Dominguez M. Imaginal discs secrete insulin-like peptide 8 to mediate plasticity of growth and maturation. Science. 2012;336:579-82 PMID 22556250 CrossRef
  473. Djuranovic S, Nahvi A, Green R. miRNA-mediated gene silencing by translational repression followed by mRNA deadenylation and decay. Science. 2012;336:237-40 PMID 22499947 CrossRef
  474. Chowdhury T, Arghandawi S, Brand J, Akanji O, Bader D, Salter D, et al. Dynamic compression counteracts IL-1beta induced inducible nitric oxide synthase and cyclo-oxygenase-2 expression in chondrocyte/agarose constructs. Arthritis Res Ther. 2008;10:R35 PMID 18348730 CrossRef
  475. Yang X, Goldberg M, He M, Xu H, Blevins J, Norgard M. Differential expression of a putative CarD-like transcriptional regulator, LtpA, in Borrelia burgdorferi. Infect Immun. 2008;76:4439-44 PMID 18663002 CrossRef
  476. Jenkins S, Rückerl D, Cook P, Jones L, Finkelman F, Van Rooijen N, et al. Local macrophage proliferation, rather than recruitment from the blood, is a signature of TH2 inflammation. Science. 2011;332:1284-8 PMID 21566158 CrossRef
  477. Tao X, Avalos J, Chen J, MacKinnon R. Crystal structure of the eukaryotic strong inward-rectifier K+ channel Kir2.2 at 3.1 A resolution. Science. 2009;326:1668-74 PMID 20019282 CrossRef
  478. Chen J, Li H, Addabbo F, Zhang F, Pelger E, Patschan D, et al. Adoptive transfer of syngeneic bone marrow-derived cells in mice with obesity-induced diabetes: selenoorganic antioxidant ebselen restores stem cell competence. Am J Pathol. 2009;174:701-11 PMID 19147816 CrossRef
  479. Shirato H, Ogawa S, Ito H, Sato T, Kameyama A, Narimatsu H, et al. Noroviruses distinguish between type 1 and type 2 histo-blood group antigens for binding. J Virol. 2008;82:10756-67 PMID 18701592 CrossRef
  480. Somvanshi V, Sloup R, Crawford J, Martin A, Heidt A, Kim K, et al. A single promoter inversion switches Photorhabdus between pathogenic and mutualistic states. Science. 2012;337:88-93 PMID 22767929 CrossRef
  481. Iliev I, Funari V, Taylor K, Nguyen Q, Reyes C, Strom S, et al. Interactions between commensal fungi and the C-type lectin receptor Dectin-1 influence colitis. Science. 2012;336:1314-7 PMID 22674328 CrossRef
  482. Epstein J, Tewari K, Lyke K, Sim B, Billingsley P, Laurens M, et al. Live attenuated malaria vaccine designed to protect through hepatic CD8⁺ T cell immunity. Science. 2011;334:475-80 PMID 21903775 CrossRef
  483. Moore D, Blackmore M, Hu Y, Kaestner K, Bixby J, Lemmon V, et al. KLF family members regulate intrinsic axon regeneration ability. Science. 2009;326:298-301 PMID 19815778 CrossRef
  484. Lu W, Casanueva M, Mahowald A, Kato M, Lauterbach D, Ferguson E. Niche-associated activation of rac promotes the asymmetric division of Drosophila female germline stem cells. PLoS Biol. 2012;10:e1001357 PMID 22802725 CrossRef
  485. Walser R, Burke J, Gogvadze E, Bohnacker T, Zhang X, Hess D, et al. PKCβ Phosphorylates PI3Kγ to Activate It and Release It from GPCR Control. PLoS Biol. 2013;11:e1001587 PMID 23824069 CrossRef
  486. Chae Y, Woo J, Kim M, Kang S, Kim M, Lee J, et al. Expression of aquaporin 5 (AQP5) promotes tumor invasion in human non small cell lung cancer. PLoS ONE. 2008;3:e2162 PMID 18478076 CrossRef
  487. Song Y, Smith R, To B, Millar A, Imaizumi T. FKF1 conveys timing information for CONSTANS stabilization in photoperiodic flowering. Science. 2012;336:1045-9 PMID 22628657 CrossRef
  488. Fisher M, Huang Y, Li X, McIver K, Toukoki C, Eichenbaum Z. Shr is a broad-spectrum surface receptor that contributes to adherence and virulence in group A streptococcus. Infect Immun. 2008;76:5006-15 PMID 18710861 CrossRef
  489. Circu M, Rodriguez C, Maloney R, Moyer M, Aw T. Contribution of mitochondrial GSH transport to matrix GSH status and colonic epithelial cell apoptosis. Free Radic Biol Med. 2008;44:768-78 PMID 18267208 CrossRef
  490. John K, Ragavan N, Pratt M, Singh P, Al-Buheissi S, Matanhelia S, et al. Quantification of phase I/II metabolizing enzyme gene expression and polycyclic aromatic hydrocarbon-DNA adduct levels in human prostate. Prostate. 2009;69:505-19 PMID 19143007 CrossRef
  491. Kang S, Akerblad P, Kiviranta R, Gupta R, Kajimura S, Griffin M, et al. Regulation of early adipose commitment by Zfp521. PLoS Biol. 2012;10:e1001433 PMID 23209378 CrossRef
  492. Eagle R, Flack G, Warford A, Martinez-Borra J, Jafferji I, Traherne J, et al. Cellular expression, trafficking, and function of two isoforms of human ULBP5/RAET1G. PLoS ONE. 2009;4:e4503 PMID 19223974 CrossRef
  493. Endsley M, Thill R, Choudhry I, Williams C, Kajdacsy-Balla A, Campbell W, et al. Expression and function of fatty acid amide hydrolase in prostate cancer. Int J Cancer. 2008;123:1318-26 PMID 18566995 CrossRef
  494. Liu C, Fu X, Liu L, Ren X, Chau C, Li S, et al. Sequential establishment of stripe patterns in an expanding cell population. Science. 2011;334:238-41 PMID 21998392 CrossRef
  495. Stenzel W, Muller U, Kohler G, Heppner F, Blessing M, McKenzie A, et al. IL-4/IL-13-dependent alternative activation of macrophages but not microglial cells is associated with uncontrolled cerebral cryptococcosis. Am J Pathol. 2009;174:486-96 PMID 19147811 CrossRef
  496. Wu X, Zhou T, Zhu J, Zhang B, Georgiev I, Wang C, et al. Focused evolution of HIV-1 neutralizing antibodies revealed by structures and deep sequencing. Science. 2011;333:1593-602 PMID 21835983 CrossRef
  497. Chatoo W, Abdouh M, David J, Champagne M, Ferreira J, Rodier F, et al. The polycomb group gene Bmi1 regulates antioxidant defenses in neurons by repressing p53 pro-oxidant activity. J Neurosci. 2009;29:529-42 PMID 19144853 CrossRef
  498. Nancy P, Tagliani E, Tay C, Asp P, Levy D, Erlebacher A. Chemokine gene silencing in decidual stromal cells limits T cell access to the maternal-fetal interface. Science. 2012;336:1317-21 PMID 22679098 CrossRef
  499. Szabó A, Papin C, Zorn D, Ponien P, Weber F, Raabe T, et al. The CK2 Kinase Stabilizes CLOCK and Represses Its Activity in the Drosophila Circadian Oscillator. PLoS Biol. 2013;11:e1001645 PMID 24013921 CrossRef
  500. Xu J, Peng C, Sankaran V, Shao Z, Esrick E, Chong B, et al. Correction of sickle cell disease in adult mice by interference with fetal hemoglobin silencing. Science. 2011;334:993-6 PMID 21998251 CrossRef
  501. Tian Y, Sommerville L, Cuneo A, Kelemen S, Autieri M. Expression and suppressive effects of interleukin-19 on vascular smooth muscle cell pathophysiology and development of intimal hyperplasia. Am J Pathol. 2008;173:901-9 PMID 18669613 CrossRef
ISSN : 2329-5139